| 甜瓜EIN3/EILs基因家族全基因组鉴定与进化分析 |
| |
| 引用本文： | 马勇,莘少红,巴德仁贵,哈斯阿古拉. 甜瓜EIN3/EILs基因家族全基因组鉴定与进化分析[J]. 广西农业生物科学, 2014, 0(1): 105-112 |
| |
| 作者姓名： | 马勇 莘少红 巴德仁贵 哈斯阿古拉 |
| |
| 作者单位： | [1]内蒙古大学生命科学学院/内蒙古自治区牧草与特色作物生物技术重点实验室,呼和浩特010021 [2]包头师范学院生物科学与技术学院,包头014030 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金（31360486）; 内蒙古大学提升综合实力重点项目（1402020201058）; 包头师范学院青年科学研究基金项目（BSYKJ2013-29）共同资助 |
| |
| 摘 要： | 以拟南芥的EIN3/EILs蛋白保守结构域为探针序列,对甜瓜全基因组的蛋白质数据库进行搜索,搜索后获得4个EIN3/EILs蛋白序列。对甜瓜EIN3/EILs基因家族的系统进化、序列相似性、基因结构进行了分析。通过对所有甜瓜的EIN3/EILs基因的表达谱分析得知该基因家族在各组织中均有表达,其中在果实以及愈伤组织中高丰度特异表达,不同基因之间的表达模式差异明显。
|
| 关 键 词： | 甜瓜 EIN3 EILs蛋白 基因家族 进化分析 |
Genome-wide Identification and Phylogenetic Analysis of the EIN3/EILs Gene Family in Melons |
| |
| Affiliation: | Ma Yong , Shen Shaohong , Bade Rengui , Hasi Agula ( 1 Inner Mongolia Key Laboratory of Herbage ＆ Endemic Crop Biotechnology, College of Life Sciences, Inner Mongolia University, Hohhot, 010021; 2 Department of Biological Science and Technology, Baotou Teacher＇s College, Baotou, 014030) |
| |
| Abstract: | Four EIN3/EILs genes were identified from the melon genome protein database which was based on conserved domains of EIN3/EILs proteins as probe sequences in A rabidopsis. Phylogenetic analysis, numbers of intron analysis, alignment of sequence similarity were performed in EIN3/EILs gene family in melon. By means of analyzing unigenes which matched with EIN3/EILs proteins, the result show that EIN3/EILs genes were expressed in different tissues, part of genes specific expressed with high abundance in fruit and callus, and different members ofEIN3/EILs gene family exhibits difference in patterns of expression. |
| |
| Keywords: | Melon EIN3/EILs protein Gene family Phylogenetic analysis |
| 本文献已被 维普 等数据库收录！ |
|
