| 180日龄文昌鸡和隐性白羽克洛鸡基因结构及SNP分析 |
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| 引用本文： | 顾丽红,刘志勇,张细权,邱峰芳,邢增杨,赵建国,林哲敏. 180日龄文昌鸡和隐性白羽克洛鸡基因结构及SNP分析[J]. 畜牧与兽医, 2019, 0(3): 7-15 |
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| 作者姓名： | 顾丽红 刘志勇 张细权 邱峰芳 邢增杨 赵建国 林哲敏 |
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| 作者单位： | 海南省农业科学院畜牧兽医研究所;海南大学热带农林学院;华南农业大学;东华理工大学;文昌龙泉文昌鸡实业有限公司 |
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| 摘 要： | 采用生物信息学的方法对180日龄文昌鸡和隐性白羽克洛鸡RNA-Seq的94 614 632的Clean Reads进行了单核苷酸多态性(SNP)的查找、可变剪接筛查、基因结构优化和新转录本预测。结果共得到可靠的SNP位点220 308个,可变剪接56 119个,优化了21 633个基因,预测到1 235个新转录本。本研究结果能够进一步完善鸡基因组注释情况并丰富鸡SNP数据库和可变剪切数据库。
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| 关 键 词： | 文昌鸡 RNA测序 可变剪接 单核苷酸多态性 新转录本 |
Gene structure and SNP analysis of 180 day old Wenchang chicken and Recessive White Rock chicken |
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