| 猪圆环病毒2型感染PK-15细胞差异表达miRNA和mRNA互作网络 |
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| 引用本文： | 李畅,李静,何启盖.猪圆环病毒2型感染PK-15细胞差异表达miRNA和mRNA互作网络[J].畜牧兽医学报,2019(1):115-125. |
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| 作者姓名： | 李畅 李静 何启盖 |
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| 作者单位： | 华中农业大学农业微生物学国家重点实验室;华中农业大学动物医学院 |
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| 基金项目： | 国家生猪产业技术体系资助项目(CARS-35) |
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| 摘 要： | 旨在筛选猪圆环病毒2型感染猪肾上皮细胞(PK-15)后差异表达miRNA和mRNA,并探究miRNA和mRNA之间的互作关系。使用茎环定量PCR检测多个热点miRNA在PCV2感染组和未接种病毒组之间的差异表达水平以发现差异表达miRNA,分析PCV2感染后第12小时的蛋白质组学研究结果(GEO登录号:GSE71945)以获得差异表达mRNA,并分析差异表达miRNA和mRNA之间的互相作用关系。结果显示,在PCV2感染后第12小时miR-10b、miR-128、miR-155-5p、miR-21、miR-29b、miR-361-3p等表达量显著性变化,使用miRecords预测其靶基因,分别发现7 105、9 741、7 451、7 183、7 971、8 793个靶基因;PCV2感染后第12小时共有158个差异表达mRNA,分属于多种细胞结构成分并参与多条重要的细胞生物途径,且差异miRNA的靶基因和差异mRNA之间有大量的交集基因。上述结果表明,PCV2感染能导致细胞内多种miRNA差异表达,造成miRNA的靶基因表达紊乱,进而影响细胞正常的生命进程。
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| 关 键 词： | 猪圆环病毒2型 PK-15细胞 MIRNA MRNA 互作关系 |
Integrated Analysis of miRNA and mRNA Network of Porcine Circovirus 2 Infecting Porcine Kidney Cell Line |
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| LI Chang,LI Jing,HE Qigai.Integrated Analysis of miRNA and mRNA Network of Porcine Circovirus 2 Infecting Porcine Kidney Cell Line[J].Acta Veterinaria et Zootechnica Sinica,2019(1):115-125. |
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| Authors: | LI Chang LI Jing HE Qigai |
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| Institution: | (State Key Laboratory of Agricultural Microbiology,Huazhang Agricultural University,Wuhan 430070,China;College of Animal Science and Veterinary Medicine,Huazhong Agricultural University,Wuhan 430070,China) |
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| Abstract: | LI Chang;LI Jing;HE Qigai(State Key Laboratory of Agricultural Microbiology,Huazhang Agricultural University,Wuhan 430070,China;College of Animal Science and Veterinary Medicine,Huazhong Agricultural University,Wuhan 430070,China) |
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| Keywords: | porcine circovirus 2(PCV2) PK-15 miRNA mRNA interaction relationship |
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