| 沙门菌基因分型研究进展 |
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| 引用本文： | 张文成,朱丽萍,颜世敢.沙门菌基因分型研究进展[J].畜牧与兽医,2019(8):142-145. |
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| 作者姓名： | 张文成 朱丽萍 颜世敢 |
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| 作者单位： | 齐鲁工业大学/山东省科学院生物工程学院山东省微生物工程重点实验室 |
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| 摘 要： | 沙门菌是一种常见的致病菌,种类繁多,具有2 600多种血清型。近年来,基于基因序列的分型方法被应用于沙门菌基因分型的研究中,并且显示了很好的分型能力,并成为沙门菌传染病暴发调查和分子流行病学分析中的常规工具。基因分型方法主要有:脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE)、基因组重复序列PCR(repetitive extragenic palindromic PCR,Rep-PCR)、多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)、全基因组单核苷酸多态性分型(whole gene single nucleotide polymorphism,wgSNP)、核心基因组多位点序列分型(core genome multilocus sequence typing,cgMLST)等,每种分型方法也有各自的优缺点和使用条件及适用范围。其中,随着全基因组测序(WGS)时代的到来,cgMLST和wgSNP方法已经成为当前研究热点。
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| 关 键 词： | 沙门菌 基因分型 MLST cgMLST wgSNP |
Advances in research on Salmonella genotyping |
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