| 10株猪流行性腹泻病毒云南分离株的S基因克隆及分子特征 |
| |
| 引用本文： | 钱祁昇,朱丽,苏琳琳,张天羽,赵翔玥,郑晓林,吕念词,柴俊,张以芳.10株猪流行性腹泻病毒云南分离株的S基因克隆及分子特征[J].畜牧与兽医,2019(5):101-107. |
| |
| 作者姓名： | 钱祁昇 朱丽 苏琳琳 张天羽 赵翔玥 郑晓林 吕念词 柴俊 张以芳 |
| |
| 作者单位： | 云南农业大学动物医学院 |
| |
| 基金项目： | 国家重点研发计划专项(2017YFD0500105);云南省重点研发计划(2018BB004) |
| |
| 摘 要： | 自2013年来,猪流行性腹泻病(PED)的暴发给云南省养猪业带来严重的经济损失。本研究对2018年来自云南4个地区的42份病料中分离出的6株猪流行性腹泻病毒(PEDV)的部分S基因进行扩增,并结合在2013年所分离到的来自云南4个地区的4株PEDV流行株,进行分子特征和遗传进化分析。结果显示:这2年的分离株和CV777株相比,2018年分离株的核苷酸和氨基酸突变位点增加了12个和7个,且有3个丝氨酸突变都是在COE结构域(69、101和146)。系统发育分析表明,2018和2013年分离株的核苷酸和氨基酸的同源性为95.6%～98.8%,95%～98.8%;分别与CV777株相比,核苷酸和氨基酸的同源性差异较小(94.9%～95.5%和92.7%～95.4%;94.5%～95.2%和93.4%～94.2%),亲缘关系都较远。2013年的分离株主要分布在G2b亚群,而2018年的分离株主要分布在G2a和G2c亚群,具有遗传多样性。N-糖基化和磷酸化位点预测分析显示,在216位上预测的N-糖基化位点由NSSI→NSSF,尤其是COE结构域中的丝氨酸取代而导致其可预测磷酸化。这些变异很可能会影响其抗原性和疫苗效果,导致PEDV控制效果不好。本研究阐明了云南部分地区PEDV流行毒株的分子流行病学和遗传特征,为该地区PED的防控奠定理论基础。
|
| 关 键 词： | 猪流行性腹泻病毒 PEDV S基因 分子特征 系统发育分析 |
Cloning and molecular characterization of the S gene of 10 Yunnan strains of porcine epidemic diarrhea virus |
| |
| QIAN Qisheng,ZHU Li,SU Linlin,ZHANG Tianyu,ZHAO Xiangyue,ZHENG Xiaolin,LU Nianc-i,CHAI Jun,ZHANG Yifang.Cloning and molecular characterization of the S gene of 10 Yunnan strains of porcine epidemic diarrhea virus[J].Animal Husbandry & Veterinary Medicine,2019(5):101-107. |
| |
| Authors: | QIAN Qisheng ZHU Li SU Linlin ZHANG Tianyu ZHAO Xiangyue ZHENG Xiaolin LU Nianc-i CHAI Jun ZHANG Yifang |
| |
| Institution: | (College of Veterinary Medicine,Yunnan Agricultural University,Kunming 650201,China) |
| |
| Abstract: | QIAN Qisheng;ZHU Li;SU Linlin;ZHANG Tianyu;ZHAO Xiangyue;ZHENG Xiaolin;LU Nianc-i;CHAI Jun;ZHANG Yifang(College of Veterinary Medicine,Yunnan Agricultural University,Kunming 650201,China) |
| |
| Keywords: | porcine epidemic diarrhea virus PEDV spike gene molecular characterization phylogenetic analysis |
| 本文献已被 CNKI 维普 等数据库收录！ |
|
