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杜仲HDR基因全长cDNA克隆与序列分析
引用本文:刘攀峰,杜红岩,乌云塔娜,杜兰英,孙志强.杜仲HDR基因全长cDNA克隆与序列分析[J].林业科学研究,2013,26(4):447-453.
作者姓名:刘攀峰  杜红岩  乌云塔娜  杜兰英  孙志强
作者单位:1. 中国林业科学研究院经济林研究开发中心,河南郑州,450003
2. 国家林业局经济林育种与栽培重点实验室,湖南长沙,410004
基金项目:国家公益性行业科研专项(201004029)
摘    要:以杜仲叶片cDNA为模板,采用反转录RCR及RACE技术分离出HDR基因的cDNA克隆,命名为EuHDR。EuHDR基因cDNA全长1 653 bp,5’端非编码区长82 bp,3’端非编码区长188 bp,编码460个氨基酸,与喜树HDR基因序列相似性最高,达82%;推导EuHDR氨基酸序列中包含转运肽序列(A1-A33)及植物HDR蛋白多个保守的功能位点(A117,A208,A262,A345);EuHDR蛋白二级结构α-螺旋占35.65%,β-折叠占19.78%,螺环结构占44.57%;EuHDR蛋白三级结构为单体形式,呈不规则的三叶草形状;系统进化分析表明EuHDR蛋白与葡萄HDR蛋白的亲缘关系最为接近。

关 键 词:杜仲  HDR  基因  序列分析
收稿时间:2012/8/28 0:00:00

Cloning and Sequence Analysis of 1-Hydroxy-2-Methyl-2-E-Butenyl-4-Diphosphate Reductase Gene cDNA from Eucommia ulmoides
LIU Pan-feng,DU Hong-yan,WUYUN Ta-n,DU Lan-ying and SUN Zhi-qiang.Cloning and Sequence Analysis of 1-Hydroxy-2-Methyl-2-E-Butenyl-4-Diphosphate Reductase Gene cDNA from Eucommia ulmoides[J].Forest Research,2013,26(4):447-453.
Authors:LIU Pan-feng  DU Hong-yan  WUYUN Ta-n  DU Lan-ying and SUN Zhi-qiang
Institution:1(1.Non-timber Forestry Research and Development Center,Chinese Academy of Forestry,Zhengzhou 450003,He’nan,China;2.Key Laboratory of Non-wood Forest Products of State Forestry Administration,Changsha 410004,Hu’nan,China)
Abstract:
Keywords:Eucommia ulmoides  HDR gene  sequence analysis
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