松辽黑猪IGF-Ⅰ基因5′调控区序列特征分析 |
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作者姓名: | 刘畅 王大力 白文林 张金玉 张树敏 赵志辉 |
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作者单位: | [1]吉林大学畜牧兽医学院,长春130062 [2]黑龙江八一农垦大学动物科技学院,大庆163319 [3]沈阳农业大学畜牧兽医学院,沈阳110161 [4]吉林省农业科学院畜牧分院,公主岭136100 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(30771543);;“863”项目(2008AA10Z136);;吉林省科技发展计划项目(20070567) |
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摘 要: | 对松辽黑猪类胰岛素样生长因子-Ⅰ(IGF-Ⅰ)基因5′调控区进行了T-A克隆和序列测定,在分析序列结构特征的基础上与GenBank中野猪、大白猪、牛、山羊、绵羊进行了比较基因组学和系统进化研究。结果表明:松辽黑猪IGF-Ⅰ基因5′调控区存在C/EBPb、MATal、Oct-1、CF-1等多个潜在的转录因子结合位点,可能与IGF-Ⅰ的转录调控和起始以及特异表达有关。在该非编码序列中,重复序列所占比率为2.22%,不存在SINEs、LINEs、LTR类反转录元件和DNA转座子元件,而发现存在1个(CA)18微卫星位点。在松辽黑猪IGF-Ⅰ基因5′调控区,松辽黑猪与野猪、大白猪、牛、山羊、绵羊各物种间同源性大小分别为99.0%、98.8%、90.7%、91.6%、90.6%。MUPD法构建的分子系统进化树聚类结果表明,野猪与大白猪先聚为一类,再与松辽黑猪聚类形成一个大分支,而山羊和绵羊先聚成一类,再与牛聚类形成一个大分支,然后再与猪的一支汇合在一起。
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关 键 词: | 松辽黑猪 IGF-Ⅰ基因 克隆 启动子 |
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