不同成熟期桃品种NAC基因遗传多样性研究

从11个桃品种嫩叶中分别提取基因组DNA,根据GDR数据库中NAC基因序列信息,设计特异引物,PCR扩增,对产物克隆测序。然后,使用DNAman软件进行核苷酸和氨基酸序列比对,使用ORF Finder获得开放阅读框和推导氨基酸序列,使用CDD工具进行蛋白质结构域分析,利用Blastp工具搜索同源蛋白,采用Mega软件绘制系统进化树。结果发现,NAC蛋白第16~140位存在1个NAC结构域,N端比较保守,C端则多样性比较高;核苷酸变异有SNP和Indel 2类,津柳早红和小白桃在第3外显子区SNP和Indel变异数量非常多,说明这2个品种的NAC基因结构具有独特性。蛋白比对发现,桃NAC与梅同源性最高,其次是鸭梨;进化树体现了物种的亲缘关系。结果表明,参试品种NAC基因存在比较丰富的遗传多样性,在保守区内的氨基酸变异可能影响蛋白的功能。