杜鹃红山茶实时定量PCR 内参基因筛选及验证 |
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引用本文: | 刘小飞,于 波,黄丽丽,孙映波. 杜鹃红山茶实时定量PCR 内参基因筛选及验证[J]. 广东农业科学, 2020, 47(12): 203-211 |
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作者姓名: | 刘小飞 于 波 黄丽丽 孙映波 |
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作者单位: | 广东省农业科学院环境园艺研究所/ 广东省园林花卉种质创新综合利用重点实验室/农业农村部华南都市农业重点实验室,广东 广州 510640 |
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基金项目: | 广东省重点领域研发计划项目(2018B020202002);广东省科技计划项目(2018A050506054);广州市科技计划项目(201604020031,201807010016) |
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摘 要: | 【目的】实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)以高灵敏度和特异性等优点,成为基因表达分析的主要工具,而选择适合不同条件下工作的内参是qRT-PCR分析的前提。筛选得到适用于杜鹃红山茶不同器官、不同时期花瓣的qRT-PCR分析的内参基因,为后续相关基因功能研究提供可用的内参基因。【方法】选择转录延伸因子编码基因(EF1α)、α-tubulin(TUA)、β-tubulin(TUB)、Ubiquitin(UBQ)、肌动蛋白(Actin)和甘油醛-3-磷酸脱氢酶(Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)6个看家基因,使用2种不同的计算程序GeNorm和NormFinder评估了6个基因表达的稳定性。进一步通过CaGASA3基因的表达模式验证了所选内参基因的适用性。【结果】在不同器官中通过GeNorm和NormFinder筛选出稳定性最好的基因,排名前2位的均为TUA和GAPDH,GAPDH基因在两种计算程序评估中稳定性均最佳。而在不同时期花瓣中,通过2种程序得出排名前2位的内参基因均为TUB和UBQ;UBQ基因在GeNorm程序评估中稳定性最好,TUB基因在NormFinder程序的评估中稳定性最佳。【结论】杜鹃红山茶不同器官中最佳内参基因为TUA和GAPDH,不同时期花瓣中最适内参基因为TUB和UBQ。
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关 键 词: | 实时荧光定量PCR;杜鹃红山茶;内参基因;GeNorm;NormFinder |
Screening and Validation of Reference Genes of Camellia azalea by Quantitative Real-time PCR |
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Abstract: | |
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Keywords: | qRT-PCR Camellia azalea reference gene GeNorm NormFinder |
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