| 鸡传染性法氏囊病毒VP2蛋白B细胞抗原表位预测 |
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| 引用本文： | 李玉,李功勇,黄军龙.鸡传染性法氏囊病毒VP2蛋白B细胞抗原表位预测[J].广东畜牧兽医科技,2010,35(2):31-35. |
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| 作者姓名： | 李玉 李功勇 黄军龙 |
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| 作者单位： | 清远市动物卫生监督所,广东,清远,511515 |
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| 摘 要： | 以鸡传染性法氏囊病毒VP2蛋白的基因组序列为基础,采用Garnier-Robson方法、Chou-Fasman方法和Karplus-Schultz方法预测VP2蛋白质的二级结构;用Kyte-Doolittle方案预测蛋白质的亲水性;用Emini方案预测蛋白质的表面可能性;用Jameson-Wolf方案预测氨基酸的抗原性指数。综合分析,预测VP2蛋白的抗原表位。通过以上几种方法预测IBDV病毒VP2蛋白的B细胞表位位于VP2蛋白N端3-10、30-45、77-84、150-157、197-206、211-222、278-288、298-303、315-325、376-381、386-394、403-411、415-425区段。
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| 关 键 词： | 法氏囊病毒 VP2蛋白 B细胞表位 二级结构 预测 |
B cell epitopes prediction of VP2 protein of IBDV |
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| Li Yu,Li Gongyong,Huang Junlong.B cell epitopes prediction of VP2 protein of IBDV[J].Guangdong Journal of Animal and Veterinary Science,2010,35(2):31-35. |
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| Authors: | Li Yu Li Gongyong Huang Junlong |
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| Institution: | Qingyuan Institute of Animal Health Supervision;Qingyuan 511515;China |
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| Abstract: | The secondary structure of the VP2 protein of IBDV was predicted using the methods of Garnier-Robson,Chou-Fasman and Karplus-Schultz according to the genome of IBDV.The hydrophilicity plot,surface probability plot and antigenic index were obtained by the methods of Kyte-Doolittle,Emini and Jameson-Wolf respectively.Combining the above results the B cell epitopes for the VP2 protein were located at the n-terminal 3-10,30-45,77-84,150-157,197-206,211-222,278-288,298-303,315-325,376-381,386-394,403-411,and 415... |
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| Keywords: | Infectiousbursaldiseasevirus VP2protein Bcellepitope secondarystructure prediction |
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