77份山西黍稷DNA二维码身份证的构建 |
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作者姓名: | 曹越 曹晓宁 陈凌 Santra Dipak K 乔治军 王瑞云 |
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作者单位: | 1. 山西农业大学农学院;2. 山西农业大学农业基因资源研究中心/农业部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室/杂粮种质资源发掘与遗传改良山西省重点实验室;3. 内布拉斯加大学林肯分校农艺系小宗粮豆研究与推广中心 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(31271791);;国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-06-14.5-A16);;山西省重点研发项目(2022ZDYF110); |
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摘 要: | 为了更好地管理黍稷资源,分辨其身份以及追溯来源,创建一个高效可行的种质资源鉴定系统十分必要。以山西省内各地77份黍稷资源为材料,用上海生工生物股份有限公司合成上游5’端加FAM (blue)荧光基团标记对77份黍稷资源进行PCR及毛细管电泳。结果发现,仅用5个标记组合(RYW3、RYW6、RYW20、RYW37和RYW40)可区分全部材料。其中,组合RYW6+RYW37可区分60份;组合RYW6+RYW20+RYW37可区分69份;组合RYW6+RYW20+RYW37+RYW40可区分73份;组合RYW3+RYW6+RYW20+RYW37+RYW40可区分全部77份。77份材料在8个位点共检出79个等位变异,每个位点检出平均为9.875个,检测到的有效等位变异(Ne)为2.675 9,Shannon多样性指数(I)为0.991 6,Nei’s基因多样性指数(Nei)为0.426 0,多样性信息含量(PIC)为0.553 3。在此基础上,利用ID analysis 4.0在线条形码生成器将对应字符串生成可扫描的条形码DNA分子身份证;利用二维码在线技术将材料基本信息转化成可扫描的二维码D...
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关 键 词: | SSR 黍稷 二维码 山西 |
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