甘蓝型油菜千粒重全基因组关联分析 |
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引用本文: | 肖小军,韩德鹏,周会汶,肖国滨,郑伟,李亚贞,黄天宝,肖富良,陈明,吕伟生,周庆红.甘蓝型油菜千粒重全基因组关联分析[J].中国油料作物学报,2023(3):510-517. |
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作者姓名: | 肖小军 韩德鹏 周会汶 肖国滨 郑伟 李亚贞 黄天宝 肖富良 陈明 吕伟生 周庆红 |
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作者单位: | 1. 江西农业大学农学院;2. 江西省红壤研究所/江西省红壤耕地保育重点实验室/国家红壤改良工程技术研究中心;3. 九江学院 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(31860392,32160463);;国家油菜产业技术体系建设专项(CARS-12); |
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摘 要: | 为指导千粒重遗传改良,挖掘甘蓝型油菜千粒重显著关联单核苷酸多态性(SNP)位点及相关候选基因,以300份甘蓝型油菜种质资源为材料,对千粒重进行一年两地表型考察,结合该群体前期开发的201 817个SNP标记,采用一般线性模型(GLM)和混合线性模型(MLM)进行全基因组关联分析,对性状显著关联SNP位点两侧100kb区域内相关候选基因进行功能预测。结果表明,300份甘蓝型油菜千粒重在两地均表现出广泛的表型变异,筛选出6份千粒重较高的油菜种质资源。基于GLM、MLM模型分别检测到24个和10个与油菜千粒重显著关联的SNP,其中有8个SNP在2个模型中均被检测到,位于第C02号染色体上Bn-C02-22853028的表型贡献率最大。6个位点附近找到HWS、DA1、DA2、CPL3、bZIP、CSPs、PTR2、ARF2、TRM61等9个拟南芥已报道粒重基因的同源基因。
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关 键 词: | 甘蓝型油菜 全基因组关联分析 千粒重 SNP位点 同源基因 |
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