中华鳖群体间编码MHCⅠ类分子α2结构域基因的克隆及序列分析

通过主要组织相容性复合体（MHC）基因的分析，探讨了中华鳖5个群体（黄河、淮河、洞庭湖、鄱阳湖、太湖）间的遗传变异与分化。中华鳖编码MHCⅠ类分子α2结构域基因的多态性很丰富。主要表现在：（1）中华鳖编码MHCⅠ类分子α2结构域的基因序列存在插入或缺失变异，共获得7种不同长度的基因序列，其中222bp、231bp分别在42、23个体出现，为两种主要长度的基因序列；（2）共获得41种不同的核苷酸序列，这些核苷酸序列的相似度在0．386—0．995之间，表明序列间的歧异度较大；（3）在所有核苷酸序列中，共有250个有效位点，其中174个为变异位点，多态位点百分率达69．6％，但群体间存在差异：①多态位点百分率大小顺序为鄱阳湖鳖（71．02％）〉太湖鳖（58．05％）〉淮河鳖（57．69％）〉黄河鳖（55．32％）〉洞庭湖鳖（48．09％）；②核苷酸多样性指数（π）大小顺序为鄱阳湖鳖（0．4273）〉太湖鳖（0．2872）〉洞庭湖鳖（0．2840）〉黄河鳖（0．2727）〉淮河鳖（0．2463）；（4）分子方差分析（AMOVA）表明，太湖鳖与黄河鳖、淮河鳖2群体间，淮河鳖与洞庭湖鳖间有极显著的遗传分化（P〈0．001）；（5）根据核苷酸序列的平均遗传距离，用UPGMA和NJ法进行聚类分析，黄河鳖与淮河鳖、洞庭湖鳖与太湖鳖分别先聚在一起，最后再与鄱阳湖鳖聚类，显示鄱阳湖鳖与其它4群体中华鳖在MHC基因上有明显歧化。

Cloning and sequencing analysis of the gene encoding MHC class I molecule alpha 2 domain in populations of Trionyx sinensis