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胡萝卜类黄酮含量的测定及DcCHS基因家族的鉴定分析
引用本文:张新业,王雨欣,孙艳香,朱 姝,王聪艳,李文静. 胡萝卜类黄酮含量的测定及DcCHS基因家族的鉴定分析[J]. 西北农业学报, 2021, 30(4): 572-581
作者姓名:张新业  王雨欣  孙艳香  朱 姝  王聪艳  李文静
作者单位:(1.廊坊师范学院 生命科学学院,河北廊坊 065000;2.河北省动物多样性重点实验室,河北廊坊 065000;3.廊坊市细胞工程与应用研究重点实验室,河北廊坊 065000)
基金项目:河北省高等学校科学技术研究项目(BJ2018044);廊坊市科技支撑计划项目(2019012003)。
摘    要:查尔酮合成酶(chalcone synthase, CHS)是类黄酮合成过程中的第一个关键酶,具有重要的生理功能。测定胡萝卜不同发育时期、不同组织部位的类黄酮含量,并在全基因组水平上对胡萝卜CHS基因家族进行鉴定和分析。结果表明,无论在苗期还是收获期,胡萝卜叶中的类黄酮含量均极显著地高于根中的含量。叶中的类黄酮含量在不同发育时期无显著差异,而根中的类黄酮含量在不同发育时期却差异显著。胡萝卜基因组中共有12个DcCHS基因,分布于5条染色体上,氨基酸序列长度为253~398 aa,外显子1~3个。经预测,DcCHS蛋白均定位于细胞质,二级结构以α-螺旋和无规卷曲为主。DcCHS蛋白可分为ClassⅠ和ClassⅡ两类,含有10种保守基序,motif1、4、6、7为CHS蛋白N端结构域,motif2、3、8为CHS蛋白C端结构域。这些研究结果可为胡萝卜CHS基因的功能研究提供参考。

关 键 词:胡萝卜;类黄酮含量测定;查尔酮合成酶;基因家族鉴定;生物信息学分析

Determination of Flavonoid Content in Carrot (Daucus carota subsp.sativus) and Identification of DcCHS Gene Family
ZHANG Xinye,WANG Yuxin,SUN Yanxiang,ZHU Shu,WANG Congyan and LI Wenjing. Determination of Flavonoid Content in Carrot (Daucus carota subsp.sativus) and Identification of DcCHS Gene Family[J]. Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica, 2021, 30(4): 572-581
Authors:ZHANG Xinye  WANG Yuxin  SUN Yanxiang  ZHU Shu  WANG Congyan  LI Wenjing
Abstract:
Keywords:Carrot (Daucus carota subsp.sativus)   Determination of flavonoids content   Chalcone synthase (CHS)   Gene family identification   Bioinformatics analysis
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