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谷子GATA基因家族的鉴定及表达分析
引用本文:卢成达,李 阳,孙 迪,牛学谦,昌秦湘. 谷子GATA基因家族的鉴定及表达分析[J]. 西北农业学报, 2021, 30(5): 645-654
作者姓名:卢成达  李 阳  孙 迪  牛学谦  昌秦湘
作者单位:(1.山西农业大学 农学院,山西太谷 030801;2.太原学院 园林科学研究所,太原 030032)
基金项目:浙江省植物次生代谢与调控重点实验室开放基金(ZWCSDX-201901);山西省重点研发计划(201803D221012-5);山西省重点研发计划(201703D211002-4-2);山西省深度贫困县科技精准扶贫专项(2019FP-12)。
摘    要:本研究从谷子基因组水平鉴定出33个SiGATA成员,命名为SiGATA1~SiGA TA33.利用生物信息学方法对谷子SiGATA家族的系统发育、基因结构、染色体分布、保守基序、蛋白三级结构和顺式调控元件进行预测和分析.结果 表明,33个SiGATA转录因子被划分为3组,不均匀的分布在8条染色体上,多数含有CX2CX1...

关 键 词:谷子(Setaria italica)  GATA  生物信息学  表达分析

Genome-wide Identification and Expression Analysis of GATA gene Family in Foxtail Millet
LU Chengd,LI Yang,SUN Di,NIU Xueqian and CHANG Qinxiang. Genome-wide Identification and Expression Analysis of GATA gene Family in Foxtail Millet[J]. Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica, 2021, 30(5): 645-654
Authors:LU Chengd  LI Yang  SUN Di  NIU Xueqian  CHANG Qinxiang
Abstract:
Keywords:Foxtail millet(Setaria italica)   GATA   Bioinformatics   Expression analysis
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