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| 牛GDF5基因启动子的克隆与序列分析 | |
| 引用本文： | 刘永峰,昝林森,赵栓平,亐开兴,李林强,张莺莺,唐中林,杨述林,牟玉莲,崔文涛. 牛GDF5基因启动子的克隆与序列分析[J]. 畜牧兽医学报, 2010, 41(4) |
| 作者姓名： | 刘永峰 昝林森 赵栓平 亐开兴 李林强 张莺莺 唐中林 杨述林 牟玉莲 崔文涛 |
| 作者单位： | 1. 西北农林科技大学动物科技学院,杨凌,712100;中国农业科学院北京畜牧兽医研究所畜禽遗传资源与利用农业部重点开放实验室,北京,100193 2. 西北农林科技大学动物科技学院,杨凌,712100;国家肉牛改良中心,杨凌,712100 3. 西北农林科技大学动物科技学院,杨凌,712100 4. 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所畜禽遗传资源与利用农业部重点开放实验室,北京,100193 |
| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划(863计划)，科技支撑计划项目，陕西省"13115"科技创新计划项目，国家重点基础研究发展规划(973计划) |
| 摘 要： | 旨在了解生长分化因子5(GDF5)可能的调控序列。本研究通过基因组比对,扩增了牛GDF5基因5′侧翼区,并通过产物纯化、连接、转化及测序比对,确定了2043bp的启动子序列。同时综合考虑已经证实的人GDF5基因启动子结构及应用启动子在线分析软件,对该序列进行分析。结果发现,牛GDF5基因5′侧翼区没有CpG岛,序列比对发现,牛和人GDF5基因启动子区域同源性为78%;牛GDF5基因启动子没有TATAbox或CAATbox结构,其转录起始位点位于翻译起始密码子ATG上游-359bp位置,其潜在的转录因子有AML-la,Ap-1,AmL-la,CdxA,SRY,CdxA,TATA,AmL-la,GTATA-1,MZF1,CdxA,Nkx-2,CdxA,S8和SRY,其中Ap-1,AmL-la,SRY,Nkx-2,S8和SRY高度保守,与人的序列完全一致;推测发现牛GDF5基因启动子-457至-423bp序列中的GT重复序列可以增强启动子的活性,且最小增强子处于-458和-377bp之间。研究结果推测判定了牛GDF5基因启动子的转录起始位置、转录结合位点、活性序列及最小增强子序列,为以后深入研究GDF5基因在牛软骨细胞中的表达机制提供了理论基础。 |
| 关 键 词： | 牛 GDF5基因 启动子 克隆 转录因子 |
Cloning and Sequence Analysis of the Bovine GDF5 Gene Promoter |
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| LIU Yong-feng,ZAN Lin-sen,ZHAO Shuan-ping,QU Kai-xing,LI Lin-qiang,ZHANG Ying-ying,TANG Zhong-lin,YANG Shu-lin,MU Yu-lian,CUI Wen-tao. Cloning and Sequence Analysis of the Bovine GDF5 Gene Promoter[J]. Chinese Journal of Animal and Veterinary Sciences, 2010, 41(4) | |
| Authors: | LIU Yong-feng ZAN Lin-sen ZHAO Shuan-ping QU Kai-xing LI Lin-qiang ZHANG Ying-ying TANG Zhong-lin YANG Shu-lin MU Yu-lian CUI Wen-tao |
| Affiliation: | LIU Yong-feng1,2,ZAN Lin-sen1,3,ZHAO Shuan-ping1,QU Kai-xing1,LI Lin-qiang1,ZHANG Ying-ying1,TANG Zhong-lin2,YANG Shu-lin2,MU Yu-lian2,CUI Wen-tao2(1.College of Animal Science , Technology,Northwest A & F University,Yangling 712100,China,2.Key Laboratory for Farm Animal Genetic Resources , Utilization of Ministry ofAgriculture of China,Institute of Animal Science,Chinese Academy of AgriculturalSciences,Beijing 100193,3.National Beef Cattle ImprovementCentre of China,China) |
| Abstract: | This experiment was conducted to study the potential regulatory sequences of growth differentiate factor 5(GDF5).The 5' flanking region of bovine GDF5 gene was amplified through comparing human GDF5 gene,and then a 2 043 bp promoter sequence was confirmed after product purification,ligation,transformation and sequence.In addition,considering the confirmed human GDF5 promoter structure and the analytic result of promoter online software,the promoter sequence was analyzed.It was found that there are no CpG is... |
| Keywords: | |
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