| 草本纤维提取用菌株的PCR-16S rDNA及ITS-RFLP分析 |
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| 引用本文： | 段盛文,刘正初,郭刚,冯湘沅,郑科,成莉凤.草本纤维提取用菌株的PCR-16S rDNA及ITS-RFLP分析[J].湖北农业科学,2009,48(9). |
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| 作者姓名： | 段盛文 刘正初 郭刚 冯湘沅 郑科 成莉凤 |
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| 作者单位： | 中国农业科学院麻类研究所,长沙,410205 |
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| 基金项目： | 国家科技基础条件平台建设项目 |
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| 摘 要： | 通过分析从沤麻水中分离到的8株草本纤维提取用菌株的16S rDNA以及ITS序列,鉴定并构建其聚类图,明确草本纤维提取用菌株的遗传关系.通过BLAST比对16S rDNA并用限制性内切酶酶切16～23S的ITS保守序列,对参试菌株的16S rDNA及ITS酶切片段进行聚类分析.结果表明,8株菌株分别属于地表芽孢杆菌、梭状芽孢杆菌、蜡状芽孢杆菌、短小芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌以及多粘类芽孢杆菌:基于16S rDNA序列与ITS-RFLP所获得的聚类结果基本一致,菌株1251与菌株1172-1聚为一类,其余聚为一类,但种内聚类存在一定的差异,可能与不同类型的序列进化程度有关,8株菌株的16SrDNA序列的相似性为78.66%;Alu Ⅰ、Hinf Ⅰ、Sau3A Ⅰ、Taq Ⅰ 4种限制性内切酶对参试的8株草本纤维提取用产芽孢菌株的ITS进行酶切,各获得0～4条100～440bp的酶切产物.
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| 关 键 词： | 草本纤维 产芽孢菌株 |
Analysis of the Herbaceous Extraction Sporeformers Based on PCR-16S rDNA and ITS-RFLP |
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| DUAN Sheng-wen,LIU Zheng-chu,GUO gang,FENG Xiang-yuan,ZHENG Ke,CHENG Li-feng.Analysis of the Herbaceous Extraction Sporeformers Based on PCR-16S rDNA and ITS-RFLP[J].Hubei Agricultural Sciences,2009,48(9). |
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| Authors: | DUAN Sheng-wen LIU Zheng-chu GUO gang FENG Xiang-yuan ZHENG Ke CHENG Li-feng |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | PCR-16S rDNA ITS-RFLP |
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