基于转录组测序挖掘甜荞自交不亲和相关功能基因 |
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作者姓名: | 张建 黄科慧 刘洋 唐恬 吴银环 王于栋 陶建波 王艺钢 姜澳华 刘佳琦 方小梅 易泽林 |
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作者单位: | 1. 西南大学农学与生物科技学院/重庆市荞麦产业创新团队 |
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基金项目: | 重庆市自然科学基金项目(CSTB2022NSCQ-MSX1034);;中央高校基本业务费专项(SWU119070,XDJK2019C038,XDJK2019D022); |
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摘 要: | 普通甜荞属于花柱异长型自交不亲和1年生草本作物,营养价值丰富.为了探明甜荞育性和花型发育的重要功能途径和关键基因,以自交不亲和普通甜荞乌克兰大粒荞和自交亲和甜荞品种甜自21为材料,分别对盛花期的甜自21等柱花,乌克兰大粒荞长柱花和短柱花雌雄蕊进行转录组测序,获得283 170条平均长度为1 351 bp, N50为2 040 bp的Unigenes,其中有68 813条差异表达基因(DEGs). GO功能富集分析显示,自交不亲和甜荞中长、短柱花雌雄蕊中的差异基因主要富集在导管形成和导管发育过程中;KEGG代谢通路分析显示,自交不亲和甜荞(S-型和L-型)与自交亲和甜荞(H-型)雌雄蕊中差异基因主要富集在倍半萜和三萜化合物合成途径中;自交不亲和甜荞长、短柱花雌雄蕊中差异基因(L vs S)主要富集在植物激素信号转导途径中.倍半萜和三萜化合物合成途径共富集到77个差异基因,其中三萜化合物合成途径基因在自交不亲和甜荞中下调表达,倍半萜化合物合成途径基因以上调表达为主.植物激素信号转导途径中,与自交亲和型等柱花雌雄蕊比较,生长素、茉莉酸和赤霉素信号通路中的差异表达基因在自交不亲和型长、短柱花雌...
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关 键 词: | 甜荞 雌雄蕊 RNA-Seq 自交亲和性 花柱发育 |
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