| 民猪耐寒基因目标风险最小特征搜索 |
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| 引用本文： | 杨月莹,刘 娣.民猪耐寒基因目标风险最小特征搜索[J].西北农业学报,2013,22(10):15-21. |
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| 作者姓名： | 杨月莹 刘 娣 |
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| 作者单位： | （1.黑龙江省农业科学院 博士后科研工作站，哈尔滨 150086；2.东北林业大学 博士后科研流动站，哈尔滨 150040；3. 东北农业大学 理学院，哈尔滨 150030；4. 黑龙江省农业科学院，哈尔滨 150086） |
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| 基金项目： | 黑龙江省自然科学青年基金（QC2012C034）；黑龙江省博士后基金（LBH Z10039）。 |
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| 摘 要： | 面对小样本海量特征的基因芯片数据，准确高效地筛选分类特征基因是数据分析的重要工作。通过制备常温状态和低温状态两类地方民猪样本的基因芯片数据，以抗寒性状相关基因筛选为目的，提出目标风险最小特征搜索算法，通过设定目标参数筛选出抗寒性状相关的基因集合。这些抗寒性状相关基因对两类样本分类效果非常好，通过与经典的分类方法相比较，多种方法都获得稳定高效的分类准确率，该特征筛选过程获得的抗寒相关基因具有较强的分类效能。通过基因功能生物学注释，得到特征基因所在的功能结点信息，这些已知基因的功能为进一步研究特征基因集合中未知基因的功能提供了试验设计依据。目标风险最小特征搜索的同时可以进行样本分类和重要分类特征的筛选，适用于基因表达谱数据的统计分析。
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| 关 键 词： | 基因芯片 特征搜索 抗寒 分类效能 目标风险最小特征算法 |
Screening for Anti freezing Genes in Pig with Target Risk minimized Feature searching Algorithm |
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| YANG Yueying,and LIU Di.Screening for Anti freezing Genes in Pig with Target Risk minimized Feature searching Algorithm[J].Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica,2013,22(10):15-21. |
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| Authors: | YANG Yueying and LIU Di |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Microarray Characteristics Anti freezing Classification performance Target risk minimized feature searching algorithm (TRFA) |
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