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禽白血病病毒B、E和J亚群基因芯片检测方法的建立
引用本文:张 悦,徐福洲,陈小玲,苏 霞,王家鑫,杨 兵. 禽白血病病毒B、E和J亚群基因芯片检测方法的建立[J]. 中国动物检疫, 2012, 29(6): 37-42
作者姓名:张 悦  徐福洲  陈小玲  苏 霞  王家鑫  杨 兵
作者单位:1. 河北农业大学生命科学学院,河北保定 071001
2. 北京市农林科学院畜牧兽医研究所,北京 100097
基金项目:马流感、禽淋巴白血病等畜禽疫病快速检测技术的研究(KJCX201104001)
摘    要:目的基于多重PCR技术,建立禽白血病病毒(ALV)的B、E、J亚群的基因芯片分型和检测方法。方法根据NCBI已收录的ALV三个亚群的参考毒株cDNA序列,在各亚群特异性基因突变区两端选取其保守区域,设计合成三个亚群的通用上游引物1条,以及B、E亚群的通用下游引物和J亚群下游引物各1条,将上述引物用Cy3标记,建立多重PCR体系;参考靶序列内部的三个亚群各自的保守区域,选择亚群之间基因突变位点多的区域,设计合成5条寡核苷酸探针,制作寡核苷酸探针基因检测芯片;以寄主细胞DF-1中提取传代ALV的cDNA,以及合成NCBI收录的各亚群参考毒株的cDNA序列作为检测模板;利用Cy3标记的PCR扩增产物,与基因芯片进行杂交反应,扫描结果。结果芯片准确检测并分型三个亚群的参考毒株,其检测灵敏度能够达到102个基因拷贝,且与禽类常见的四种病毒均无交叉反应。结论本研究结果证明,基因芯片技术是一种ALV的B、E和J亚群进行检测和分型的有效方法,且具有较高的特异性和灵敏度,为今后在临床应用中快速鉴别诊断ALV等免疫抑制病提供可行性。

关 键 词:禽白血病病毒  亚群  基因芯片  多重PCR

Development of a Gene Chip Assay for the Detection of Avian Leucosis Virus Subgroups B,E and J
Zhang Yue,Xu Fuzhou,Chen Xiaoling,Su Xi,Wang Jiaxin,Yang Bing. Development of a Gene Chip Assay for the Detection of Avian Leucosis Virus Subgroups B,E and J[J]. China Animal Health Inspection, 2012, 29(6): 37-42
Authors:Zhang Yue  Xu Fuzhou  Chen Xiaoling  Su Xi  Wang Jiaxin  Yang Bing
Affiliation:1.College of Life Sciences,Agricultural University of Hebei,Baoding 071001;2.Institute for Animal Husbandry and Veterinary Medicine,Beijing Municipal Academy of Agriculture and Forestry,Beijing 100097)
Abstract:
Keywords:Avian leucosis virus  Subgroup  Gene chip  multiplex PCR
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