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| 牛病毒性腹泻病毒HB-DCZ株E0基因的克隆与抗原表位预测 | |
| 引用本文： | 蒋禄峰,赵月兰,李苏楠,常丽云,张梦茜,包永占,秦建华.牛病毒性腹泻病毒HB-DCZ株E0基因的克隆与抗原表位预测[J].中国兽医学报,2013,33(7). |
| 作者姓名： | 蒋禄峰 赵月兰 李苏楠 常丽云 张梦茜 包永占 秦建华 |
| 作者单位： | 1. 河北农业大学动物科技学院,河北保定,071001 2. 河北农业大学动物医学院,河北保定,071001 3. 吉林大学畜牧兽医学院,吉林长春,130062 |
| 摘 要： | 根据GenBank上发表的牛病毒性腹泻病毒(BVDV) Oregon C24V株E0基因的核苷酸序列设计1对特异性引物,应用PCR技术扩增BVDV HB-DCZ株E0基因.将PCR产物克隆到pMD18-T载体,克隆产物进行序列测定与分析.结果显示,HB-DCZ cDNA体外扩增获得特异性条带,约为687 bp.序列测定结果表明,HB-DCZ株E0基因由681个核苷酸组成,编码227个氨基酸.与已公开发表的BVDV其他毒株核苷酸和推导氨基酸序列同源性相似顺序依次为:CCSYD 99％和98.7％、QHZK10 98.4％和97.8％、VEDEVAC 98.2％和97.8％、Oregon C24V80.9％和89.9％、Yak 74.2％和81.1％.HB-DCZ与CCSYD、QHZK10以及VEDEVAC株的遗传距离较近,与国际标准毒株C24V、Yak株的遗传距离较远.运用Kyte-Doolittle方案预测氨基酸的亲水性,采用Karplus-Schulz方案预测蛋白质的柔性区域,按Jameson-Wolf方案预测抗原指数,利用Emini方案预测蛋白质的表面可及性.对预测结果综合分析,推测最有可能的B细胞表位位于N-端6～17、23～29、47～53、59～68、70～81、97～109、114～122、127～134、137～143、165～172、186～198和213～220. |
| 关 键 词： | 牛病毒性腹泻病毒 E0基因 克隆 序列分析 抗原表位预测 |
Cloning and sequence analysis of E0 gene of bovine viral diarrhea virus HB-DCZ strain |
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| Abstract: | |
| Keywords: | bovine viral diarrhea virus the E0 gene cloning sequence analysis predicted of the antigenic epitope |
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