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| 基于血凝素裂解位点的DNA条形码在A型流感病毒分型中的应用 | |
| 引用本文： | 孟慧芝,孙涛,岳志芹,王文斌.基于血凝素裂解位点的DNA条形码在A型流感病毒分型中的应用[J].中国动物检疫,2015,32(7):55-61. |
| 作者姓名： | 孟慧芝 孙涛 岳志芹 王文斌 |
| 作者单位： | 1. 山东出入境检验检疫局，山东青岛 266000; 山西农业大学，山西太谷 030801 2. 山东出入境检验检疫局,山东青岛,266000 3. 山西农业大学,山西太谷,030801 |
| 基金项目： | 国家科技支撑计划（2012BAK11B00） |
| 摘 要： | 为了建立一种快速鉴别AIV的HA亚型的RT-PCR方法，本研究探讨了流感病毒血凝素裂解位点基因作为DNA条形码对A型流感病毒进行亚型鉴定的可行性。通过生物信息学方法对16种A型流感病毒的血凝素基因全长进行比对，在HA裂解位点的两端高度保守区设计一对DNA条形码引物，RT-PCR扩增获得约170bp的核苷酸片段。利用MEGA5.0软件构建N-J系统树并计算亚型间及亚型内平均遗传距离。结果显示，不同A型流感病毒裂解位点氨基酸具有单系性，每一亚型可分别形成各自独立的分支。不同亚型间平均遗传距离为0.277，相同亚型内平均遗传距离0.032。研究表明，利用DNA条形码技术可在A型流感病毒分型方面进行有效的分子分类鉴定。 |
| 关 键 词： | A型流感病毒 血凝素(HA) DNA条形码 亚型鉴定 |
Application of DNA Barcoding Based on Hemagglutinin Cleavage Site for Influenza A Virus Sub-typing |
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| Meng Huizhi,Sun Tao,Yue Zhiqin,Wang Wenbin.Application of DNA Barcoding Based on Hemagglutinin Cleavage Site for Influenza A Virus Sub-typing[J].China Journal Of Animal Quarantine,2015,32(7):55-61. | |
| Authors: | Meng Huizhi Sun Tao Yue Zhiqin Wang Wenbin |
| Abstract: | |
| Keywords: | influenza A virus hemagglutinin(HA) DNA barcoding technology subtype |
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