| 萝卜EST—SSR反应体系的建立与优化 |
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| 引用本文： | 韩晓雨,王淑芬,魏佑营,刘贤娴,付卫民.萝卜EST—SSR反应体系的建立与优化[J].山东农业科学,2011(10):1-3,7. |
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| 作者姓名： | 韩晓雨 王淑芬 魏佑营 刘贤娴 付卫民 |
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| 作者单位： | 1. 山东农业大学园艺科学与工程学院,山东泰安,271018
2. 山东省农业科学院蔬菜研究所/山东省设施蔬菜生物学重点实验室/国家蔬菜改良中心山东分中心,山东济南,250100 |
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| 基金项目： | 山东省现代农业产业技术体系，山东省农业重大应用技术创新课题，山东省农业良种工程项目 |
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| 摘 要： | 利用正交设计L16（4^5）对萝卜SSR—PCR反应体系的5因素（Taq酶、Mg^2＋、模板DNA、dNTP、引物）在4个水平上进行优化，获得了最佳反应体系，即20山反应体系中含有0．10mmol／LdNTP，3．0mmol／LMg^2＋，50ng模板，0．500μmol／L引物，1．0UTaq酶。使用优化的反应体系，扩增条带清晰，可满足不同引物组合和萝卜材料的要求。此研究为今后利用SSR技术对萝卜种质资源进行分类、构建遗传图谱和基因定位奠定了基础。
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| 关 键 词： | 萝卜 EST—SSR 正交设计 体系优化 分子标记 |
Establishment and Optimization of EST- SSR System for Radish |
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| HAN Xiao-yu,WANG Shu-fen,WEI You-ying,LIU Xian-xian,FU Wei-min.Establishment and Optimization of EST- SSR System for Radish[J].Shandong Agricultural Sciences,2011(10):1-3,7. |
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| Authors: | HAN Xiao-yu WANG Shu-fen WEI You-ying LIU Xian-xian FU Wei-min |
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| Institution: | (1.College of Horticultural Science and Engineering,Shandong Agricultural University,Taian 271018,China; 2.Institute of Vegetables,Shandong Academy of Agricultural Sciences,Jinan 250100,China) |
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| Abstract: | The orthogonal design L16(45)was used to optimize the EST-SSR system for radish at four levels of five factors(dNTP,primer,Mg2+,Taq DNA polymerase and template DNA).The 20 μl optimal SSR-PCR reaction system included 0.10 mmol/L dNTP,3.0 mmol/L Mg2+,50 ng template DNA,0.500 μmol/L primer and 1.0 U Taq DNA polymerase.With the optimal system,the obtained bands were clear and could meet the requirements of different primer combinations and radish materials.This study provided basis for the analysis of diversity,genetic map construction and gene localization of radish germplasm resources by SSR technique. |
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| Keywords: | Radish(Raphanus sativus L ) EST-SSR Orthogonal design System optimization Molecular marker |
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