| 文心兰OnCOBRA基因克隆及表达模式分析 |
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| 引用本文： | 李玲,赖钟雄,陈裕坤,练从龙,林鹤延.文心兰OnCOBRA基因克隆及表达模式分析[J].热带作物学报,2014,35(8):1551-1558. |
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| 作者姓名： | 李玲 赖钟雄 陈裕坤 练从龙 林鹤延 |
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| 作者单位： | 福建农林大学园艺植物生物工程研究所;福建农林大学园艺植物生物工程研究所;福建农林大学园艺植物生物工程研究所;福建农林大学园艺植物生物工程研究所;福建农林大学园艺植物生物工程研究所 |
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| 基金项目： | 福建省农业科技平台（No. 2008N2001）；国家科技支撑计划（No. 2007BAD07B03）。 |
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| 摘 要： | 以文心兰试管苗为材料,采用RT-PCR结合RACE法,克隆文心兰OnCOBRA基因的cDNA全长和DNA序列。结果表明:COBRA全长为1 601 bp,开放阅读框(ORF)为1 386 bp,共编码461个氨基酸;OnCOBRA的DNA序列共2 949 bp,且含有6个外显子和5个内含子。生物信息学结果表明,OnCOBRA属于不稳定的疏水蛋白,具有信号肽、跨膜结构和CCVS保守区域,亚细胞定位于细胞膜中;与无油樟、玉米、籼稻、拟南芥等具有较高的同源性。系统进化树分析结果表明,文心兰OnCOBRA蛋白与玉米(ZmCOBRA)、无油樟(AtCOBRA)、籼稻(OsCOBRA)处于统一分枝,推测OnCOBRA基因是COBRA基因家族的成员。qPCR结果表明,OnCORBA为组成型表达,在成苗期表达量最高,在文心兰类原球茎时期表达量最低。
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| 关 键 词： | 文心兰 COBRA 克隆 生物信息学 qPCR |
Molecular Cloning and Expression Pattern of OnCOBRA Gene in Oncidium |
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| LI Ling,LAI Zhongxiong,CHEN Yukun,LIAN Conglong and LIN Heyan.Molecular Cloning and Expression Pattern of OnCOBRA Gene in Oncidium[J].Chinese Journal of Tropical Crops,2014,35(8):1551-1558. |
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| Authors: | LI Ling LAI Zhongxiong CHEN Yukun LIAN Conglong and LIN Heyan |
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| Institution: | Institute of Horticultural Biotechnology, Fujian Agriculture and Forestry University;Institute of Horticultural Biotechnology, Fujian Agriculture and Forestry University;Institute of Horticultural Biotechnology, Fujian Agriculture and Forestry University;Institute of Horticultural Biotechnology, Fujian Agriculture and Forestry University;Institute of Horticultural Biotechnology, Fujian Agriculture and Forestry University |
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