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尖孢镰孢菌与番茄互作早期milRNA调控功能研究
作者姓名:畅引东  贾仡伟  何瑞  张萌  孟广军  李新凤  张作刚  王建明
作者单位:1. 山西农业大学植物保护学院农业有害生物综合治理山西省重点实验室;2. 山西省植物保护植物检疫中心
基金项目:山西省重点研发计划项目(201903D211001-1);
摘    要:[目的]MicroRNA通过调控其靶基因在生物活动中起到重要的作用,本研究目的是为了明确尖孢镰孢菌与番茄互作早期相关milRNAs的分子功能及调控机制。[方法]采用实时荧光定量PCR法对尖孢镰孢菌番茄专化型菌株侵染寄主早期pri-milRNAs和milRNAs靶基因进行基因表达分析,利用STRING蛋白互作网络数据库和Cytoscape软件预测该菌株milRNAs与靶基因间的蛋白互作网络,并结合DAVID在线分析工具对相关基因进行生物学功能分析。[结果]实时荧光定量PCR结果表明,供试的pri-milRNA_2a和pri-milRNA_2b与FOXG_03470、pri-milRNA_3b与FOXG_04910、pri-milRNA_4与FOXG_08812、pri-milRNA_6与FOXG_00067表达趋势基本相反,4个miLRNA与相应基因可能存在靶标关系;蛋白互作网络预测结果可知,尖孢镰孢菌fox_milRNA_1、fox_milRNA_2、fox_milRNA_3和fox_milRNA_8的靶基因间互作较为紧密。其中,fox_milRNA_1的靶基因FOXG_04240与f...

关 键 词:microRNA-like RNA  初级milRNA  蛋白互作网络  尖孢镰孢菌  靶基因
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