| 猪ATGL基因5′调控区的SNPs检测及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 华绪川,张立凡,蒋晓玲,翟继鹏,徐宁迎,张金枝.猪ATGL基因5′调控区的SNPs检测及生物信息学分析[J].中国畜牧杂志,2011(5). |
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| 作者姓名： | 华绪川 张立凡 蒋晓玲 翟继鹏 徐宁迎 张金枝 |
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| 作者单位： | 浙江大学动物科学学院;浙江省畜牧兽医局; |
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| 基金项目： | 国家重点基础发展规划项目(2006CB102100); 浙江省科技厅重大项目(2005C122005-2); 浙江省博士后科研择优资助项目(2008X80801) |
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| 摘 要： | 脂肪甘油三酯水解酶(ATGL)是脂肪组织脂肪动员过程中的水解限速酶,主要催化甘油三酯水解为甘油二酯。研究对金华猪、岔路黑猪、杜洛克、大约克和皮特兰5个猪种ATGL基因其5′调控区1.2 kb的片段进行SNPs检测和生物信息学分析。结果表明:ATGI基因5'调控区存在第-845位G→C和第-854位T→C的连锁突变。序列分析显示该区域可能存在启动子区,且2个突变都会导致其部分潜在转录因子结合位点的产生或消失。采用PCR-RFLP方法检测g-845G→C座位在金华猪、岔路黑猪、杜洛克、大约克和皮特兰中的分布情况,卡方分析结果显示,3种基因型在5个猪种中的分布存在极显著差异(P<0.01),提示不同猪种间脂肪性状的差异可能与ATGL基因5'调控区的基因突变有关。
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| 关 键 词： | ATGL基因 脂肪性状 序列分析 PCR-RFLP 猪 |
SNPs Detection and Bioinformatics Analysis on 5′ Regulatory Region of the Porcine ATGL Gene |
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| HUA Xu-chuan,ZHANG Li-fan,JIANG Xiao-ling,ZHAI Ji-peng,XU Ning-ying,ZHANG Jin-zhi.SNPs Detection and Bioinformatics Analysis on 5′ Regulatory Region of the Porcine ATGL Gene[J].Chinese Journal of Animal Science,2011(5). |
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| Authors: | HUA Xu-chuan ZHANG Li-fan JIANG Xiao-ling ZHAI Ji-peng XU Ning-ying ZHANG Jin-zhi |
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| Institution: | HUA Xu-chuan1,2,ZHANG Li-fan1,JIANG Xiao-ling1,ZHAI Ji-peng1,XU Ning-ying1,ZHANG Jin-zhi1(1.College of Animal Science,Zhejiang University,Zhejiang Hangzhou 310029,China,2.Zhejiang Provincial Bureau of Animal Husbandry and Veterinary Medicine,Zhejiang Hangzhou 310020,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | ATGL gene fat traits sequence analysis PCR-RFLP pig |
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