牦牛病毒性腹泻病毒E 1基因的克隆及生物信息学分析 |
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作者姓名: | 王文伯 刘亚刚 胡炳峰 杨晓农 于吉锋 冯英阳 王盼盼 |
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作者单位: | (1.西南民族大学生命科学与技术学院, 成都 610041; 2.四川省畜牧科学研究院, 成都 610041) |
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摘 要: | 参考GenBank中发表的BVDV毒株的基因组序列设计2对引物,利用套式RT-PCR方法首次成功克隆牦牛体内分离鉴定出的牛病毒性腹泻病毒E 1基因,并扩增出预期的585 bp目的片段。将扩增产物克隆至pMD18-T Vector,经质粒PCR鉴定及酶切鉴定获得阳性重组质粒并进行测序。测序结果经BLAST同源性比较分析,克隆得到的E 1基因与Osloss株同源性最高,但核苷酸同源性仅为73.3%,推导氨基酸同源性仅为82.6%,表明牦牛病毒性腹泻病毒存在较大的基因突变。这可能是该病毒为适应牦牛这种特有生物体和牦牛所生活的高原生态环境的结果,或该病毒也可能具有独立的遗传衍化来源。
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关 键 词: | 牛病毒性腹泻病毒 牦牛 E 1基因 克隆 生物信息学分析 |
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