拟南芥次生生长相关NAC转录因子保守结构域分析 |
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引用本文: | 陈 莹,孙 霞,胡尚连.拟南芥次生生长相关NAC转录因子保守结构域分析[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2009,37(5):185-194. |
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作者姓名: | 陈 莹 孙 霞 胡尚连 |
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作者单位: | 西南科技大学,生命科学与工程学院,四川,绵阳,621010
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基金项目: | 四川省教育厅自筹项目,西南科技大学博士基金 |
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摘 要: | 【目的】了解植物次生生长调控网络以及挖掘新型次生生长相关NAC转录因子。【方法】通过生物信息学手段对19个拟南芥次生生长相关NAC转录因子进行氨基酸序列比对及系统发生树的构建,寻找保守结构域,并对其保守结构域及蛋白质的二级结构、亚细胞定位等进行分析、预测。【结果】通过对19个拟南芥NAC转录因子的N端保守域进行划分,共发现A、B、C、D、E5个保守性不同、同时含有多个化学修饰位点以及疏水性区域的亚结构域,其中亚域D可能涉及DNA绑定及核定位信号功能,而位于多变氨基酸序列C端的F区与G区,可能涉及转录激活功能,而该区域也是划分次生生长相关NAC转录因子亚家族的重要区域。【结论】拟南芥NAC类转录因子的保守结构域,对于次生生长NAC转录因子家族功能的发挥具有重要作用。
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关 键 词: | 拟南芥 次生生长 NAC转录因子 生物信息 |
收稿时间: | 2008/8/12 0:00:00 |
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