普通白菜C3H类锌指蛋白基因家族鉴定及表达分析

植物CCCH (C3H)锌指蛋白是一种可识别并结合RNA的蛋白，在植物生长发育、胁迫响应中发挥重要作用。为了了解普通白菜C3H类锌指蛋白家族的特性，通过比对拟南芥C3H类锌指蛋白成员和普通白菜数据库，鉴定普通白菜中C3H类锌指蛋白家族成员，并分析其蛋白质理化性质、系统进化、染色体分布以及在花芽分化阶段不同时期的表达模式。结果显示，共鉴定到84个普通白菜C3H类锌指蛋白家族成员，根据在染色体上的顺序分别命名为BrcC3H1～84，这些成员不均匀地分布在10条染色体上，其中在3号染色体上分布最多，有15名成员；蛋白质理化性质分析表明，该家族成员编码蛋白质氨基酸数量为156～1 542个，理论等电点为4.96～10.84。通过构建系统进化树可将其分为3个亚族，各亚族间基因结构及保守基序差异明显，不同的C3H模型可能是导致差异的重要因素。基因结构分析表明，BrcC3H成员多数含有1个或7个CDS。通过转录组数据对BrcC3H成员在白菜花芽分化不同阶段的表达模式进行分析，发现有21个BrcC3H基因在花芽分化临界期高表达，而在后期表达逐渐降低，其可能参与帮助启动花芽分化。这为进一步研究BrcC3...