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吉林省大豆品种(系)遗传多样性分析
引用本文:吕叶,董青松,陈亮,侯云龙,刘德泉,王跃强,张君,王新风,张玲,于维,邱红梅.吉林省大豆品种(系)遗传多样性分析[J].中国农业大学学报,2024,29(7):148-160.
作者姓名:吕叶  董青松  陈亮  侯云龙  刘德泉  王跃强  张君  王新风  张玲  于维  邱红梅
作者单位:1.吉林农业大学 农学院,长春 130118;2.吉林省农业科学院 大豆研究所/农业农村部杂交大豆育种重点实验室,长春 130033;3.吉林省种子管理总站,长春 130031
基金项目:国家重点研发计划(2021YFD1201603);吉林省农业科学院基本科研经费项目(KYJF2023DX002)
摘    要:为明确吉林省2003—2022年育成的大豆品种(系)的遗传距离和亲缘关系,选取2003—2022年育成的299份大豆品种(系)为试验材料,利用覆盖大豆基因组的SNP标记对其进行遗传多样性和群体结构分析。结果表明:1)3 240个SNP标记在参试材料中共检测出A/A、A/G、A/T等16种基因型,分子标记多态信息量(PIC)范围为0.009 9~0.556 1,平均值0.318 4;使用Powermarker vision 3.25软件,得到样本群体等位基因频率为0.688 3、平均PIC为0.318 5。2)参试材料间遗传相似系数在44.86%~95.46%,平均为63.40%;其中,遗传相似系数在60%~70%的材料最多,样本数为170份,占参试材料的56.86%。3)根据遗传距离将参试材料划分为4个类群,Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ类群分别含有8、3、115、173份品种(系);来源于同一育种单位的品种(系)一般划分到同一类群。4)进一步利用STRUCTURE进行遗传结构预测,结果显示K=4,表明参试的299份品种(系)可被划分成4组独立的遗传结构类群;第1、2、3、4遗传结构类群分别含有24、18、105、152份品种(系),第1遗传结构类群含祖先遗传物质最多,第2、3、4遗传结构类群中外引遗传物质占比逐渐增多,第4遗传结构类群中外引遗传物质占比为46.80%。综上,参试大豆品种群体总的遗传背景相对狭窄,但随着外引遗传物质的引入,第4遗传结构类群(152份)的遗传多样性显著高于总体水平。

关 键 词:大豆  品种  SNP分子标记  遗传多样性  聚类分析
收稿时间:2023/12/30 0:00:00

Genetic diversity analysis of the soybean varieties/lines in Jilin Province
LV Ye,DONG Qingsong,CHEN Liang,HOU Yunlong,LIU Dequan,WANG Yueqiang,ZHANG Jun,WANG Xinfeng,ZHANG Ling,YU Wei,QIU Hongmei.Genetic diversity analysis of the soybean varieties/lines in Jilin Province[J].Journal of China Agricultural University,2024,29(7):148-160.
Authors:LV Ye  DONG Qingsong  CHEN Liang  HOU Yunlong  LIU Dequan  WANG Yueqiang  ZHANG Jun  WANG Xinfeng  ZHANG Ling  YU Wei  QIU Hongmei
Institution:1.College of Agriculture, Jilin Agricultural University, Changchun 130118, China;2.Soybean Research Institute/Key Laboratory of Hybrid Soybean Breeding of Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Jilin Academy of Agricultural Sciences, Changchun 130033, China;3.General Station of Seed Management, Jilin Province, Changchun 130031, China
Abstract:
Keywords:soybean  variety  SNP molecular markers  genetic diversity  cluster analysis
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