| 丝羽乌骨鸡SLC38A11基因分型及其与皮肤乌色度关联分析 |
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| 引用本文： | 屠云洁,章明,巨晓军,姬改革,刘一帆,单艳菊,邹剑敏,束婧婷,赵伟东,郑国庆.丝羽乌骨鸡SLC38A11基因分型及其与皮肤乌色度关联分析[J].中国农业大学学报,2024,29(7):1-11. |
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| 作者姓名： | 屠云洁 章明 巨晓军 姬改革 刘一帆 单艳菊 邹剑敏 束婧婷 赵伟东 郑国庆 |
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| 作者单位： | 1.江苏省家禽科学研究所/江苏省家禽遗传育种重点实验室/农业农村部畜禽资源(家禽)评价利用重点实验室,江苏 扬州 225125;2.泰和凤升农牧科技有限公司, 江西 吉安,343700 |
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| 基金项目： | 江苏省农业自主创新基金项目（CX（21）2011-1）；江苏省种业振兴揭榜挂帅项目（JBGS［2021］107）；现代农业产业技术体系建设专项资金（CARS-41）；扬州市现代农业项目（YZ2021029）；江苏省现代农业产业技术体系（JATS［2023J396］） |
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| 摘 要： | 为进一步验证SLC38A11在丝羽乌骨鸡黑色素沉积中的作用，本研究采用基于飞行时间质谱分析技术对SLC38A11基因SNPs位点进行基因分型，对所有SNP位点利用Hapoview4.1进行连锁不平衡分析，并检测SNP位点是否处于H-W平衡状态，分析基因型与皮肤亮度L*值关联性，筛选对皮肤乌色度显著相关的SNP标记。结果表明：1）SLC38A11基因4个多态性位点质谱检出率为100%，每个位点都有3种基因型。SLC38A11基因SNP1位点为错义突变，SNP2、SNP3和 SNP4 3个SNPs位点均为同义突变。2）卡方检验表明，SNP1位点偏离H-W平衡（P<0.05），其他3个SNPs位点均处于H-W平衡状态（P>0.05）。SNP1位点遗传多样性较低，其他3个SNPs位点为中度多态。3）单标记关联分析表明，SNP1位点TC基因型的胸部皮肤亮度L*值显著低于CC和TT基因型（P<0.05）；SNP2位点AA基因型的胸部皮肤亮度L*值显著低于GG与GA基因型（P<0.05）；SNP3位点TT基因型的胸部皮肤亮度L*值显著低于CC与CT基因型（P<0.05）。4）SNP2、SNP3和SNP4之间的强连锁产生了3种单倍型，H3H3单倍型（AATTAA基因型）胸部皮肤亮度L*值显著低于单倍型H2H3（GACTAG）和H2H1（GGCCAA）。SNP1～SNP4 4个位点基因型合并后，TCAATTAA胸部皮肤亮度L*值显著低于CCGGCCAA、TTGACTAG和CCGACTAG。综上，SLC38A11基因与丝羽乌骨鸡胸部皮肤乌色度密切相关，TCAATTAA基因型可作为研究丝羽乌骨鸡胸部皮肤乌色度的候选分子标记，为下一步利用分子标记辅助育种加快培育乌色度高的丝羽乌骨鸡新品种提供参考。
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| 关 键 词： | 乌骨鸡 SLC38A11 乌色度 SNP位点 连锁不平衡 |
| 收稿时间： | 2023/12/20 0:00:00 |
Genotyping of SLC38A11 gene in Silky fowls and its association with skin blackness |
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| TU Yunjie,ZHANG Ming,JU Xiaojun,JI Gaige,LIU Yifan,SHAN Yanju,ZOU Jianmin,SHU Jingting,ZHAO Weidong,ZHENG Guoqing.Genotyping of SLC38A11 gene in Silky fowls and its association with skin blackness[J].Journal of China Agricultural University,2024,29(7):1-11. |
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| Authors: | TU Yunjie ZHANG Ming JU Xiaojun JI Gaige LIU Yifan SHAN Yanju ZOU Jianmin SHU Jingting ZHAO Weidong ZHENG Guoqing |
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| Institution: | 1.Jiangsu Institute of Poultry Sciences/Key Lab of Poultry Genetics and Breeding of Jiangsu Province/Key Lab for Evaluation and Utilization of Livestock and Poultry Resources (Poultry) of the Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Yangzhou 225125,China;2.Taihe Fengsheng Agriculture and Animal Husbandry Technology Co., Ltd., Ji''an 343700,China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | black-bone chickens SLC38A11 blackness SNP sites linkage disequilibrium |
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