| SCoT分子标记在沙糖橘遗传多样性分析中的应用 |
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| 引用本文： | 吴秀兰,郑福庆,徐呈祥,唐文武.SCoT分子标记在沙糖橘遗传多样性分析中的应用[J].农业科学与技术,2016(1). |
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| 作者姓名： | 吴秀兰 郑福庆 徐呈祥 唐文武 |
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| 作者单位： | 肇庆学院生命科学学院,广东肇庆,526061 |
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| 基金项目： | 广东高校优秀青年创新人才培养计划(育苗工程)项目(2012LM0135)，广东省肇庆市科技创新项目(2012G21)，广东省自然科学基金(S2013010015195).Supported by Foundation for Distinguished Young Talents in Higher Education of Guangdong |
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| 摘 要： | 目的]优化适合柑橘的SCoT反应体系,并利用优化的SCoT体系分析无籽沙糖橘和有籽沙糖橘的遗传多样性.方法]采用正交设计方法分别对反应体系中DNA模板、Mg2+、引物、dNTPs、TaqDNA聚合酶的浓度等进行优化.利用优化的体系,选用60条SCoT引物对有籽沙糖橘和无籽沙糖橘进行扩增,扩增出有差异条带进行SCAR转化.结果]优化的柑橘ScoT反应体系为:Mg2+ 1.5 mmol/L,dNTPs0.35 mmol/L,引物0.25 μmol/L,Taq酶0.5 U,模板DNA 30 ng,总反应体系为20μl.最适退火温度为50.6℃.利用优化的体系,选用60条SCoT引物对有籽沙糖橘和无籽沙糖橘进行分析,经过引物筛选,获得了较好扩增的SCoT引物共42条,通过42条SCoT引物对有籽沙糖橘和无籽沙糖橘的筛选,获得了1条有差异条带引物.结论]有籽沙糖橘和无籽沙糖橘基因组水平上存在差异.
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| 关 键 词： | 柑橘 分子标记 SCoT标记 SCAR |
Genetic Diversity Analysis of Shatangju Mandarin (Citrus reticulata) by SCoT-PCR |
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| Keywords: | Citrus Molecular marker SCoT marker SCAR |
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