| 希金斯炭疽菌PITP生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 韩长志. 希金斯炭疽菌PITP生物信息学分析[J]. 湖北农业科学, 2015, 54(3): 713-716,721 |
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| 作者姓名： | 韩长志 |
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| 作者单位： | 西南林业大学林学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室,昆明,650224 |
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| 基金项目： | 云南省优势特色重点学科生物学一级学科建设项目(50097505);云南省高校林下生物资源保护及利用科技创新团队项目(2014015);云南省教育厅科学研究基金项目(2014Y330) |
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| 摘 要： | 以酿酒酵母中已经报道的5个典型PITP序列为基础,对炭疽菌属蛋白质数据库进行Blastp比对以及关键词搜索,并通过SMART保守结构域分析,明确该菌含有4个典型的PITP;同时,通过对上述氨基酸序列进行疏水性、细胞信号肽、跨膜区结构域、亚细胞定位以及二级结构等生物信息学分析,并与其他物种中15个同源序列进行遗传关系比较分析,以期为深入开展希金斯炭疽菌(Colletotrichum higginsanum Sacc.)PITP的功能研究打下理论基础,同时,也为进一步开展其他炭疽菌的研究提供重要的理论指导。
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| 关 键 词： | 希金斯炭疽菌(Colletotrichum higginsanum Sacc.) 磷脂酰肌醇转移蛋白质 生物信息学分析 遗传关系 炭疽菌属 |
Bioinformatic Analysis on PITP in Colletotrichum higginsianum Sacc. |
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| HAN Chang-zhi. Bioinformatic Analysis on PITP in Colletotrichum higginsianum Sacc.[J]. Hubei Agricultural Sciences, 2015, 54(3): 713-716,721 |
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| Authors: | HAN Chang-zhi |
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| Affiliation: | HAN Chang-zhi;College of Forestry/Key Laboratory of Forest Disaster Warning and Control of Yunnan Province,Southwest Forestry University; |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Colletotrichum higginsanum Sacc. PITP bioinformatics analysis genetic relationship Colletotrichum spp. |
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