西北部分地区猪蛔虫rDNAITS基因序列测定及遗传变异分析 |
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引用本文: | 邹勇,吴飞,郭雅旭,耿晓蕊,张文慧,王玉霞,李希来,林青. 西北部分地区猪蛔虫rDNAITS基因序列测定及遗传变异分析[J]. 动物医学进展, 2016, 0(6): 35-39. DOI: 10.3969/j.issn.1007-5038.2016.06.008 |
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作者姓名: | 邹勇 吴飞 郭雅旭 耿晓蕊 张文慧 王玉霞 李希来 林青 |
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作者单位: | 1. 西北农林科技大学动物医学院,陕西杨凌,712100;2. 青海大学农牧学院,青海西宁,810016;3. 西北农林科技大学动物医学院,陕西杨凌 712100; 青海大学农牧学院,青海西宁 810016 |
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基金项目: | 教育部长江学者和创新团队发展计划项目(IRT13074);科技部国际合作项目(2015DFG31870) |
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摘 要: | 为了摸清西北部分地区猪蛔虫内转录间隔区(ITS)的遗传变异特点,扩增了猪蛔虫ITS基因,进行测序,依据GenBank公布的ITS序列将测序结果截为ITS1、5.8S及ITS2三段,分析比对各段序列的差异性。结果显示,所有样品ITS序列长约1 000bp,其中ITS1、5.8S和ITS2的长度分别为450bp~453bp、159bp、272bp,种内差异分别为0~0.2%、0、0。基于ITS1的种系发育分析表明,23个猪蛔虫样品均位于同一分支,而与贝蛔属蛔虫分属两个不同分支。ITS1序列不能作为区分西北不同地区猪蛔虫的种内分子标记,但可以作为区分蛔属蛔虫与贝蛔属蛔虫的种间分子标记,研究结果为猪蛔虫的鉴定和分子流行病学调查提供了基础资料。
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关 键 词: | 猪蛔虫 核糖体DNA 转录间隔区 序列测定 遗传变异 |
Sequencing and Phylogenetic Analysis on rDNA ITS Genes of Ascaris suum isolates from Different Regions in Northwest China |
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Abstract: | |
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Keywords: | Ascaris sum rDNA ITS gene sequencing genetic diversity |
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