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西北部分地区猪蛔虫rDNAITS基因序列测定及遗传变异分析
引用本文:邹勇,吴飞,郭雅旭,耿晓蕊,张文慧,王玉霞,李希来,林青. 西北部分地区猪蛔虫rDNAITS基因序列测定及遗传变异分析[J]. 动物医学进展, 2016, 0(6): 35-39. DOI: 10.3969/j.issn.1007-5038.2016.06.008
作者姓名:邹勇  吴飞  郭雅旭  耿晓蕊  张文慧  王玉霞  李希来  林青
作者单位:1. 西北农林科技大学动物医学院,陕西杨凌,712100;2. 青海大学农牧学院,青海西宁,810016;3. 西北农林科技大学动物医学院,陕西杨凌 712100; 青海大学农牧学院,青海西宁 810016
基金项目:教育部长江学者和创新团队发展计划项目(IRT13074);科技部国际合作项目(2015DFG31870)
摘    要:为了摸清西北部分地区猪蛔虫内转录间隔区(ITS)的遗传变异特点,扩增了猪蛔虫ITS基因,进行测序,依据GenBank公布的ITS序列将测序结果截为ITS1、5.8S及ITS2三段,分析比对各段序列的差异性。结果显示,所有样品ITS序列长约1 000bp,其中ITS1、5.8S和ITS2的长度分别为450bp~453bp、159bp、272bp,种内差异分别为0~0.2%、0、0。基于ITS1的种系发育分析表明,23个猪蛔虫样品均位于同一分支,而与贝蛔属蛔虫分属两个不同分支。ITS1序列不能作为区分西北不同地区猪蛔虫的种内分子标记,但可以作为区分蛔属蛔虫与贝蛔属蛔虫的种间分子标记,研究结果为猪蛔虫的鉴定和分子流行病学调查提供了基础资料。

关 键 词:猪蛔虫  核糖体DNA  转录间隔区  序列测定  遗传变异

Sequencing and Phylogenetic Analysis on rDNA ITS Genes of Ascaris suum isolates from Different Regions in Northwest China
Abstract:
Keywords:Ascaris sum  rDNA ITS gene  sequencing  genetic diversity
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