| A型产气荚膜梭菌青海分离株virR基因序列与蛋白结构分析 |
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| 引用本文： | 李清,冶贵生. A型产气荚膜梭菌青海分离株virR基因序列与蛋白结构分析[J]. 安徽农业大学学报, 2019, 46(5): 800 |
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| 作者姓名： | 李清 冶贵生 |
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| 作者单位： | 青海大学农牧学院动物医学系，西宁 810016,青海大学农牧学院动物医学系，西宁 810016 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金（31760739, 31460672）和青海省高端创新人才千人计划共同资助。 |
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| 摘 要： | 为了探究产气荚膜梭菌virR基因功能及其蛋白结构特点，提取了产气荚膜梭菌青海分离株的基因组，设计引物对virR基因进行PCR扩增和测序，使用生物软件对该基因进行序列分析和蛋白预测。结果显示，产气荚膜梭菌分离株virR基因长为759 bp，其编码252个氨基酸；分离株virR基因与参考菌株SM101、13、ATCC 13124、CP15、Del1、EHE-NE18、FORC 003、FORC 025、JIR4025、JP55、JP838、LLY N11、NCTC2837以及NCTC13170的virR基因核苷酸序列同源性和氨基酸同源性均在97%以上；二级结构预测显示分离株virR蛋白主要由α螺旋结构和β折叠组成；三级结构预测表明分离株virR蛋白有5种可信度较高的结构，蛋白功能位点预测表明分离株virR蛋白具有1个N-糖基化位点、1个cAMP和cGMP依赖性蛋白激酶磷酸化位点、2个蛋白激酶C磷酸化位点、3个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点以及1个N-豆蔻酰化位点。
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| 关 键 词： | 产气荚膜梭菌；virR基因；序列分析；蛋白结构 |
| 收稿时间： | 2019-02-28 |
Sequence and protein structure analysis of virR gene of Clostridium perfringens type a isolated strain from Qinghai |
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| LI Qing and YE Guisheng. Sequence and protein structure analysis of virR gene of Clostridium perfringens type a isolated strain from Qinghai[J]. Journal of Anhui Agricultural University, 2019, 46(5): 800 |
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| Authors: | LI Qing and YE Guisheng |
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| Affiliation: | Department of Veterinary Medicine, College of Agriculture and Animal Husbandry, Qinghai University, Xining 810016 and Department of Veterinary Medicine, College of Agriculture and Animal Husbandry, Qinghai University, Xining 810016 |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Clostridium perfringens virR gene sequence analysis protein structure |
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