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| 矩镰荚苜蓿与近缘种花苜蓿的DNA条形码筛选 | |
| 作者姓名： | 王霞 刘艳 贾秀秀 李永强 方强恩 |
| 作者单位： | 甘肃农业大学草业学院草业生态系统教育部重点实验室中-美草地畜牧业可持续发展研究中心 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金项目“花苜蓿越冬芽适应青藏高原寒冷胁迫的分子机制”(31760703);;草业生态系统教育部重点实验室开放课题“青藏高原特有种矩镰荚苜蓿的遗传多样性与分子谱系地理研究”(KLGE202212)资助; |
| 摘 要： | 为了筛选适于鉴定易混淆种矩镰荚苜蓿(Medicago archiducis-nicolai)和花苜蓿(M.ruthenica)的DNA条形码,本研究采集了两近缘种的113个样本,对6个候选条形码序列(通用序列rbcL,psbA-trnH,trnL-trnF,trnK-matK,ITS2和新序列GA3ox1)进行PCR扩增、测序和序列比对,经过barcoding gap分析、wilcoxn检验以及构建NJ系统发育树评价各序列的鉴定能力。结果显示：6条候选序列的扩增和测序成功率在85%以上;rbcL序列在两近缘种间不存在变异位点,其余5条候选序列各有不同的种内变异和种间变异;5条候选序列的种间最小遗传距离均大于种内最大遗传距离,GA3ox1,ITS2和psbA-trnH序列在种内种间存在明显的“Barcoding Gap”区域;在候选序列构建的NJ系统进化树中,利用GA3ox1和psbA-trnH,矩镰荚苜蓿和花苜蓿均能各自形成单系,但trnL-trnF,trnK-matK和ITS2不能将两个近缘种区分开。通过分析,我们推荐使用核编码基因GA3ox1作为鉴定矩镰荚苜蓿... |
| 关 键 词： | 矩镰荚苜蓿 物种界定 psbA-trnH GA3ox1 DNA条形码 |