小黑麦SWEET家族基因鉴定及其在不同逆境下表达模式分析 |
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引用本文: | 李根,牛奎举.小黑麦SWEET家族基因鉴定及其在不同逆境下表达模式分析[J].草地学报,2023(11):3310-3321. |
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作者姓名: | 李根 牛奎举 |
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作者单位: | 甘肃农业大学草业学院/草业生态系统教育部重点实验室/甘肃省草业工程实验室/中-美草地畜牧可持续发展研究中心 |
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基金项目: | 甘肃省自然科学基金重点研发项目(20YF8NA129)资助; |
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摘 要: | SWEET(Sugars will eventually be exported transporter)是近年来新发现的一类糖转运体,它在维持植物体生长发育、生理代谢、逆境胁迫响应、植物与病原菌互作等方面具有重要作用。截至目前,小黑麦(×Triticosecale)SWEET家族成员尚未被鉴定。因此,本研究基于小黑麦的转录组数据库,通过同源性检索共鉴定出16条TwSWEETs基因,生物信息学分析表明小黑麦TwSWEETs基因家族在进化关系上可分为四个枝,具有较强的保守性。它们含有6~7个跨膜螺旋结构(Transmembrane helices, TMH),共有10个motif,亚细胞定位结果预测显示多数TwSWEETs定位于质膜上。进一步利用qPCR技术分析了TwSWEETs基因在干旱(20%PEG)、寒冷(4℃)胁迫下小黑麦根系和叶片的表达模式,结果表明绝大多数TwSWEET基因的相对表达量在受到胁迫后会显著上调或下调(如TwSWEET2a,TwSWEET6a,TwSWEET12,TwSWEET16),可作为小黑麦响应干旱或寒冷胁迫的候选基因。本研究结果将为深入解析小黑麦TwSWE...
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关 键 词: | SWEET糖转运蛋白 生物信息学分析 逆境胁迫 表达模式 |
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