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东方蜜蜂微孢子虫丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶基因的 生物信息学分析
引用本文:胡颖,郭思佳,荆欣,高旭泽,刘小玉,顾小雨,李琪明,徐国钧,陈大福,郭睿.东方蜜蜂微孢子虫丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶基因的 生物信息学分析[J].安徽农业大学学报,2023,50(6):985.
作者姓名:胡颖  郭思佳  荆欣  高旭泽  刘小玉  顾小雨  李琪明  徐国钧  陈大福  郭睿
作者单位:福建农林大学动物科学学院(蜂学学院),福州 350002;福建农林大学动物科学学院(蜂学学院),福州 350002; 福建省蜂疗研究所,福州 350002
基金项目:国家自然科学基金(32172792), 国家现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-44-KXJ7), 福建省自然科学基金(2022J01131334), 福建农林大学动物科学学院(蜂学学院)科研扶持项目(郭睿), 宁夏回族自治区重点研发项目(2022BBF02037)和福建省大学生创新创业训练计划(S202110389073, S202110389070)共同资助。
摘    要:旨在解析东方蜜蜂微孢子虫丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(serine/threonine protein kinase)基因STPK的理化性质和分子特性,并对东方蜜蜂微孢子虫和其他微孢子虫的STPK进行结构域和保守基序预测及系统进化分析,以期丰富东方蜜蜂微孢子虫的STPK信息,并为深入开展STPK的功能研究提供基础。通过Expasy网站上的相关软件预测和分析STPK的理化性质、信号肽、磷酸化位点、二级结构和三级结构。使用MEME软件预测东方蜜蜂微孢子虫和其他物种STPK的保守基序。通过Mega 11.0软件对东方蜜蜂微孢子虫和其他物种的STPK进行氨基酸序列多重比对,并采用邻接法构建基于STPK的系统进化树。结果显示:东方蜜蜂微孢子虫STPK基因含2 595个核苷酸,编码的STPK蛋白含864氨基酸。分子量约为101.08 kDa,分子式为C4528H7150N1162O1379S36,脂溶系数为88.48,等电点为5.47;STPK包含40个丝氨酸磷酸化位点,24个酪氨酸磷酸化位点及23个苏氨酸磷酸化位点。东方蜜蜂微孢子虫与其他9个微孢子虫及柑橘凤蝶(Papilio xuthus)的STPK均含有2个相同的结构域(PK_Tyr_Ser_Thr和Pkinase)与5个相同的保守基序(Motif 1, Motif 2, Motif 3, Motif 4和Motif 5)。东方蜜蜂微孢子虫与其他9个微孢子虫的STPK序列一致性介于38.14%~61.06%,东方蜜蜂微孢子虫和蜜蜂微粒子虫的STPK序列一致性最高(61.06%)。东方蜜蜂微孢子虫STPK(AAJ76_500008712)与颗粒病微粒子虫(Nosema granulosis)STPK(KAF9763807.1)聚为一支,微孢子虫属(KAH9412228.1)脑炎微孢子虫(KAG5858968.1)和兔脑炎微孢子虫(ECU01_1320)的STPK聚为一支,康氏泰罗汉孢虫(KAF7683612.1)和蝗虫微孢子虫(AAT12343.1)聚为一支。研究结果明确了STPK的理化性质和分子特性,揭示东方蜜蜂微孢子虫和上述其他9种微孢子虫的STPK具有较高的保守性。

关 键 词:微孢子虫  东方蜜蜂微孢子虫  丝氨酸苏氨酸蛋白激酶  蜜蜂  分子特性  系统进化

Bioinformatic analysis of serine/threonine protein kinase gene in Nosema ceranae
HU Ying,GUO Siji,JING Xin,GAO Xuze,LIU Xiaoyu,GU Xiaoyu,LI Qiming,XU Guojun,CHEN Dafu,GUO Rui.Bioinformatic analysis of serine/threonine protein kinase gene in Nosema ceranae[J].Journal of Anhui Agricultural University,2023,50(6):985.
Authors:HU Ying  GUO Siji  JING Xin  GAO Xuze  LIU Xiaoyu  GU Xiaoyu  LI Qiming  XU Guojun  CHEN Dafu  GUO Rui
Institution:College of Animal Sciences (College of Bee Science), Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002;College of Animal Sciences (College of Bee Science), Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002; Apitherapy Research Institute of Fujian Province, Fuzhou 350002
Abstract:This study aimed to analyze the physicochemical properties and molecular characteristics of STPK gene in Nosema ceranae, and conduct prediction of structural domains and conserved motifs and conduct phylogenetic analysis of STPK proteins in N. ceranae and other microsporidia, to enrich information about N. ceranae STPK and provide a foundation for further functional investigation. Physical and chemical property, transmembrane domain, signal peptide, phosphorylation site, secondary and tertiary structures were predicted and analyzed using relevant software on Expasy website. MEME software was emplyed to identify conserved motifs within STPK in N. ceranae and other species. Multiple amino acid sequences of STPK between N. ceranae and other species
Keywords:microsporidian   Nosema ceranae  serine threonine protein kinase  honeybee  molecular characteristics  phylogenetic tree
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