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胡萝卜2个DcDREB-A1类转录因子基因的克隆与比较分析
引用本文:黄莹,徐志胜,王枫,宋雄,田畅,熊爱生.胡萝卜2个DcDREB-A1类转录因子基因的克隆与比较分析[J].核农学报,2015,29(1):29-39.
作者姓名:黄莹  徐志胜  王枫  宋雄  田畅  熊爱生
作者单位:南京农业大学园艺学院/作物遗传与种质创新国家重点实验室/农业部华东地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室
基金项目:教育部新世纪优秀人才支持计划(NCET-11-0670);国家自然科学基金项目(31272175);江苏省杰出青年基金项目(BK20130027);江苏高校优势学科建设项目(2011PAPD);江苏省双创计划(2011JSSC)
摘    要:植物DREB类转录因子在植物抗逆性方面具有重要作用。本文以胡萝卜黑田五寸为材料,基于胡萝卜转录组数据,通过RT-PCR方法克隆出2个DREB-A1类转录因子基因Dc DREB-A1-1和Dc DREBA1-2。序列分析显示,这2个基因均没有内含子,长度分别为780bp和669bp,分别编码259和222个氨基酸;预测其蛋白质相对分子质量分别为29.0KD和24.71KD,p I值分别为4.32和4.63。通过对氨基酸亲水/疏水性进行分析,发现这2个转录因子属于亲水性蛋白。实时定量PCR分析表明,Dc DREB-A1-1和Dc DREB-A1-2基因在胡萝卜不同组织中的表达量不同,分别在叶和根中表达量最高。低温(4℃)、高温(38℃)、盐(0.2 mol·L-1Na Cl)、干旱(200 g·L-1PEG)不同时间段处理表达分析显示,Dc DREB-A1-1在低温、高温、盐和干旱胁迫下被显著诱导,高温、盐和干旱处理1 h后表达量达到最高,分别比对照增加14倍、7倍、7倍,低温处理下2 h表达量最高,是对照的18倍;而Dc DREB-A1-2在高温、低温和盐处理下响应明显,高温处理1 h后表达量为对照的12倍,低温和干旱处理下8 h基因表达量分别比对照增加2.4倍、6.2倍,说明2个基因在响应逆境胁迫时表达不同。胡萝卜响应非生物逆境胁迫是一个复杂的过程,本试验对深入研究胡萝卜抗逆分子机制,提高胡萝卜逆境抗性等方面具有较为重要的意义。

关 键 词:胡萝卜  转录因子  DREB类  基因克隆  表达分析
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