| 青花菜BoPGIP1基因的分子克隆及其生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 张.青花菜BoPGIP1基因的分子克隆及其生物信息学分析[J].华北农学报,2009,24(4). |
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| 作者姓名： | 张 |
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| 作者单位： | 青岛农业大学,生命科学学院,山东,青岛,266109 |
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| 基金项目： | 青岛农业大学校高层次人才启动基金 |
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| 摘 要： | 根据GenBank已发表的PGIP基因序列设计引物,通过PCR直接扩增的方法从青花菜 (Brassica oleracea var.italica P)中克隆了一个新的PGIP基因,命名为BoPGIP1.BoPGIP1基因序列全长为1 102 bp,由2个外显子和1个内含子构成,外显子总长为993 bp,编码330个氨基酸序列,分子量为37 kDa.对推导的氨基酸序列进行分析,发现该序列包含5个N-糖基化位点,2个蛋白激酶C磷酸化位点,5个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,4个N-豆蔻酰化位点.将BoPGIP1氨基酸序列与数据库中的其他植物PGIP进行同源序列比对,构建系统进化树,发现所比对基因都含有LRR结构,在145位点的LRR结构域在所有物种中极其保守;系统树显示,该序列最先与甘蓝型油菜和拟南芥聚类,其次和棉花、番茄和豆科作物的PGIP聚类,基本符合按形态特征分类的亲缘关系.
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| 关 键 词： | 克隆 序列分析 生物信息学 |
Molecular Cloning and Bioinformatic Analysis of BoPGIP1 Gene from Brassica oleracea var. Italica P |
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| ZHANG Tao.Molecular Cloning and Bioinformatic Analysis of BoPGIP1 Gene from Brassica oleracea var. Italica P[J].Acta Agriculturae Boreali-Sinica,2009,24(4). |
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| Authors: | ZHANG Tao |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | BoPGIP1 |
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