陆地棉低磷胁迫应答基因GhGDPD1的克隆与表达分析 |
| |
作者姓名: | 孟超敏 耿翡翡 卿桂霞 张富厚 李雪林 刘逢举 |
| |
作者单位: | 1. 河南科技大学农学院;2. 河南科技大学洛阳市作物遗传改良与种质创新重点实验室;3. 中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室 |
| |
基金项目: | 国家自然科学基金资助项目(31101184); |
| |
摘 要: | 【目的】基于前期陆地棉‘新陆早19’Gossypium hirsutum‘Xinluzao 19’根部低磷胁迫基因表达谱芯片差异表达序列数据分析,挖掘相关基因,并对其克隆与表达分析。【方法】克隆陆地棉‘新陆早19’GhGDPD1基因并进行基因组DNA与cDNA测序分析,借助生物信息学方法分析GhGDPD1的基因结构和进化关系;采用半定量RT-PCR技术与实时荧光定量PCR (RT-qPCR)的方法检测该基因于根、茎、叶、花等4个组织的基因表达量的变化以及低磷胁迫下的表达模式。【结果】成功克隆GhGDPD1基因,开放阅读框序列长度为1 149 bp,共编码382个氨基酸,属于GDPD家族,其中存在一个保守结构域,名为GDPD_GDE5_like_1_plant。半定量RT-PCR和RT-qPCR试验结果均显示:GhGDPD1基因主要表达于根,中量表达于花和茎,微量表达于叶。该基因在受到低磷胁迫的刺激后,立即会对低磷胁迫做出应答,胁迫4 h相对表达量达到最高值。【结论】首次成功克隆到陆地棉‘新陆早19’GhGDPD1基因,获得了GhGDPD1基因的组织表达以及低磷胁迫下的表达模式,为深入解...
|
关 键 词: | 陆地棉 低磷胁迫 基因克隆 生物信息学分析 表达分析 |
|