基于InDel标记的杏鲍菇遗传多样性评价

插入/缺失（insertion-deletion,InDel）标记作为快速鉴定品种间遗传多样性的方法之一，因具有对检测设备要求低、简单易行、成本低，且共显性遗传、变异稳定、准确性高、重复性好等特点，在医学、动植物遗传学的群体遗传分析、基因定位及遗传图谱构建等领域被广泛应用。为评价我国杏鲍菇菌株的遗传多样性，加快杏鲍菇遗传育种工作进程，通过比对杏鲍菇已公布的基因组组装数据，开发30～200 bp InDel标记便于常规电泳检测，随机选取合成36对引物对收集自国家食用菌标准菌株库、国内企业和市场的65份杏鲍菇菌株进行验证，筛选出25对有效引物，进行遗传多样性分析并构建UPGMA聚类树。结果表明，65份供试菌株遗传多样性丰富，遗传相似系数最低为0.362，在相似系数0.616时可分为5个类群。