短短芽胞杆菌B011基因组中芽胞形成调控基因spo0E的鉴定与表达分析

短短芽胞杆菌B011是一株具有广谱抗菌活性的植物内生菌，发酵后期形成芽胞。据报道，芽胞形成调控基因Spo0E的编码产物能对Spo0A～P蛋白因子去磷酸化，从而实现芽胞形成的负调控。为了能够进一步验证B011基因组中Spo0E基因的功能和表达情况，为B011菌株的遗传改造提供候选基因，本研究基于B011全基因组序列，通过生物信息学工具预测得到了9个spo0E类似基因，并与其他已公布全基因组序列的101个短芽胞杆菌Brevibacillus菌株进行比较，结果表明短短芽胞杆菌spo0E家族基因在物种分化前就已经存在。转录组测序结果表明，FO446＿19435和FO446＿04050两个spo0E家族基因在B011中高表达，表达模式表现为先升高，在发酵18 h达到最高，此后下降，这两个基因均存在SQELD基序，推测这两个基因为B011中的两个主效spo0E基因。研究结果可为短短芽胞杆菌B011的进一步开发和利用提供一定的基础。