基于微卫星多重PCR的黄鳝亲子鉴定技术

为助力黄鳝(Monopterus albus)良种选育中的亲子鉴定和系谱管理问题，利用黄鳝全基因组预测并筛选获得的16个多态性较高的微卫星标记，建立了2组微卫星多重PCR体系，并成功用于11个家系的亲子鉴定。通过Cervus 3.0软件对132尾黄鳝进行遗传多样性分析，结果显示，16个微卫星标记的平均等位基因数(Na)为5.562，平均观测杂合度(Ho)和平均期望杂合度(He)分别为0.627和0.619，平均多态信息含量(PIC)为0.564。亲子鉴定结果表明，双亲基因型未知时单亲本的累积排除概率(CE-1P)为0.999 999 99，单亲基因型已知时另一亲本的累积排除概率(CE-2P)为0.999 999 91，双亲基因型未知时双亲的累积排除概率(CE-PP)为0.999 964 76。黄鳝11个家系的模拟鉴定率为99.96%，实际鉴定率为95%。模拟分析不同亲本数的结果显示，实验的16个微卫星标记在双亲性别已知的200对亲本和双亲性别未知的150对亲本的情况下，均可达到95%以上的鉴定率。利用NTSYS软件对11个家系的110尾子代个体进行聚类分析，结果显示除2尾子代外其余10...