香菇L808细胞核与线粒体基因组注释分析

对香菇品种L808细胞核与线粒体基因组进行注释分析，结果表明，L808核基因组中含有29.48%的重复序列，以长末端逆转录重复序列（LTRs）为主，其中Gypsy超家族占到基因组的19.07%,Copia超家族仅占2.22%。经结构预测，核基因组中有11 490个编码基因，转录本平均长度1 854.69 bp，基因编码区平均长度1 418.70bp，基因外显子平均为6.19个，基因内含子平均为84.02个。共有11 227个基因得到具体注释，其中碳水化合物活性酶相关基因共660个。L808线粒体基因组全长121 411 bp，编码44个基因，包括18个蛋白质编码基因，1个核糖体基因和26个转运RNA基因，其中cox1、cox3、nad1、nad5、cob等5个基因中存在内含子。