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桂花OfACOs基因家族鉴定及表达分析
引用本文:张耀,王家璇,蔡璇,曾祥玲,杨洁,陈洪国,邹晶晶.桂花OfACOs基因家族鉴定及表达分析[J].浙江农林大学学报,2023(3):492-501.
作者姓名:张耀  王家璇  蔡璇  曾祥玲  杨洁  陈洪国  邹晶晶
作者单位:1. 湖北科技学院国家林业草原桂花工程技术研究中心
基金项目:国家自然科学基金资助项目(32271951,32101581);
摘    要:【目的】对桂花Osmanthus fragrans乙烯合成路径氨基环丙烷羧酸氧化酶(1-aminocyclopropane-1-carbox-ylate oxidase, ACO)基因家族进行了全基因组鉴定及表达分析,以探索参与桂花花瓣乙烯合成的关键ACO家族成员。【方法】以桂花品种‘柳叶金桂’O. fragrans‘Liuye Jingui’为参考基因组,对桂花OfACOs家族进行鉴定、进化分析、基因结构分析以及根、茎、叶、芽和不同开花阶段的表达模式分析。【结果】通过蛋白保守结构域(protein families,pfam)分析,从桂花基因组中共鉴定出了122个OfACOs成员,分布于22条染色体上;保守基序分析表明:大多数OfACOs基因同时包含Motif 1、 Motif 2、Motif 3、Motif 4和Motif 7这5个保守基序,它们共同组成OfACOs保守结构域;共线性分析结果表明:与拟南芥Arabidopsis thaliana基因为共线性对的基因可能具有相似的功能。结合swiss-prot同源序列对比分析,筛选出27个成员作为候选研究对象,进行不同组织部位根、茎、...

关 键 词:桂花  OfACOs  乙烯  衰老  基因家族
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