昆虫Kr-h1基因的生物信息学分析 |
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作者姓名: | 王欢 陈煜民 李凯 张微微 邓建玲 |
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作者单位: | 1. 上海农林职业技术学院植物科学技术系;2. 东华大学生物与医学工程学院 |
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基金项目: | 上海市自然科学基金(19ZR1436500,20ZR1439600); |
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摘 要: | Kr-h1基因是研究昆虫变态发育与害虫生物防治的重要靶标分子。本研究解析了昆虫Kr-h1基因结构、保守结构域、二级结构与三级结构,开展了多序列比对、表达模式分析与系统发育树重构。结果表明,Kr-h1基因外显子数量较为保守,多为2个,而内含子长度变异较大。Kr-h1蛋白一般含8个锌指结构,二维与三维结构显示锌指结构保障了蛋白的稳定性。基于全长序列的系统发育分析显示,昆虫Kr-h1为直系同源,亲缘关系与物种进化相吻合,基于锌指结构的系统发育则显示Kr-h1不同模块进化中的差异。菜粉蝶转录组数据显示,该基因表达模式与变态密切相关。本研究丰富了昆虫Kr-h1基因的知识,以期为菜粉蝶、西花蓟马等昆虫变态发育研究与生物防治提供新策略。
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关 键 词: | Kr-h1 锌指结构 系统进化分析 |
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