猪FNDC5基因生物信息学分析及表达研究 |
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作者姓名: | 黑伟 何志强 张燕伟 张万锋 蔡春波 杨阳 高鹏飞 郭晓红 曹果清 李步高 |
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作者单位: | 山西农业大学动物科学学院,山西 太谷 030801 |
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基金项目: | 三晋学者支持计划专项经费(2016,2017);山西省应用基础研究项目(NO.201901D211376,201901D211369)。 |
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摘 要: | 本试验旨在扩增抗纤维连接蛋白Ⅲ型结构域蛋白5(Fibronectin Type Ⅲ Domain Containing Protein 5,FNDC 5)基因的编码序列(Coding Sequence,CDS),通过生物信息学软件分析FNDC5的特性,并分析该基因在晋汾白猪不同组织中的表达情况。选取1日龄晋汾白猪,以背最长肌cDNA为模板克隆FDNC5基因的CDS序列,利用生物信息学方法分析FNDC5的结构和功能,采用qRT-PCR检测FDNC5基因在晋汾白猪不同组织中的表达水平。结果表明,猪FDNC5基因的CDS序列有843bp,共编码280个氨基酸。生物信息学预测,FNDC5为亲水性蛋白,二级结构中α螺旋、β转角、延伸链和无规则卷曲分别占31.79%、4.64%、20.36%和43.21%。qRT-PCR结果显示,FDNC5基因在肌肉、肝脏和心脏中高表达,在其他组织中的表达量较少。本研究结果为进一步探讨猪FDNC5基因的功能提供了参考依据。
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关 键 词: | FDNC5基因 扩增 表达 |
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