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甘蓝LFY基因的克隆及序列分析
引用本文:汤青林,王志敏,任雪松,宋明,王小佳.甘蓝LFY基因的克隆及序列分析[J].中国蔬菜,2011,1(4):17-22.
作者姓名:汤青林  王志敏  任雪松  宋明  王小佳
作者单位:西南大学园艺园林学院,南方山地园艺学教育部重点实验室,重庆市蔬菜学重点实验室,重庆 400715
基金项目:国家自然科学基金(31000908); 中央高校基本科研业务费专项资金(XDJK2009C124); 重庆市自然科学基金(2009BB1307); 西南大学博士基金(SWU110009)
摘    要:以甘蓝ZQ启动抽薹的茎尖为材料,分别提取DNA和RNA,以两对引物扩增并序列拼接得到甘蓝LFYZQ基因DNA序列和cDNA完整编码区,长度分别为2 560、1 239 bp,与花椰菜、拟南芥、芥菜和萝卜同源性分别达到91 %、87 %、86 %、87 %。该基因含有3个外显子(452、394、393 bp)和2个内含子(514、807 bp),共编码412个氨基酸,内含子剪接位点均符合经典GT-AG法则。将LFYZQ与网上公布的12种十字花科植物LFY氨基酸序列按分子进化分成两类:甘蓝LFYZQ与花椰菜以及Jonopsidium属植物Jonopsidium acaule这3个分为一类;其余10种植物分为第二大类。LFYZQ蛋白分子量为46 kD,是一个不稳定的疏水蛋白,存在N-十四(烷)酰化位点、蛋白激酶C磷酸化位点、酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、酰胺化位点共4种活性位点。

关 键 词:甘蓝  LFY  序列分析  
收稿时间:2010-08-12;

Cloning and Sequence Analysis of LFYZQ from Brassica oleracea L. var. capitata L.
TANG Qing-Lin,WANG Zhi-Min,REN Xue-song,SONG Ming,WANG Xiao-Jia.Cloning and Sequence Analysis of LFYZQ from Brassica oleracea L. var. capitata L.[J].China Vegetables,2011,1(4):17-22.
Authors:TANG Qing-Lin  WANG Zhi-Min  REN Xue-song  SONG Ming  WANG Xiao-Jia
Institution:College of Horticulture and Landscape Architecture, Southwest University, Key Laboratory of Horticulture Science for Southern Mountainous Regions, Ministry of Education, Chongqing 400715, China
Abstract:DNA and RNA were extracted from bolting stem apex of cabbage(Brassica oleracea L.var.capitata L.)cultivar ZQ and LFYZQ gene fragments were cloned by RT-PCR respectively with 2 pairs of primers.LFYZQ of DNA and cDNA sequence fragments assembly were respectively 2 560 bp and 1 239 bp.Analysis of the nucleotide sequence by BLAST on line indicated that homology of LFYZQ was up to 91 % between Brassica oleracea L.var.capitata L.and Brassica oleracea L.var.botrytis L.,up to 87 % between it and Arabidopsis thalian...
Keywords:Brassica oleracea L  var  capitata L    LFY  Sequence analysis  
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