首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
     

鸡传染性法氏囊病病毒地方流行株VP1基因片段的扩增及序列分析
引用本文:何秀苗,陈佳,康斯那,陈盛峰,韦美萍,韦平. 鸡传染性法氏囊病病毒地方流行株VP1基因片段的扩增及序列分析[J]. 动物医学进展, 2015, 0(4): 19-23
作者姓名:何秀苗  陈佳  康斯那  陈盛峰  韦美萍  韦平
作者单位:1. 广西民族大学海洋与生物技术学院,广西南宁 530006; 广西林产化学与工程重点实验室,广西南宁 530006
2. 广西民族大学海洋与生物技术学院,广西南宁,530006
3. 南宁市动物卫生监督所,广西南宁,530001
4. 广西大学,广西南宁,530004
基金项目:广西自然科学基金项目(2014GXNSFDA118018);广西高校科学技术研究项目(2013YB069,200809LX255);南宁市科技攻关项目(20142079)
摘    要:为了解鸡传染性法氏囊病病毒(IBDV)地方流行毒株在基因组B节段关键序列上的分子进化情况,通过反转录PCR(RT-PCR)技术对6个IBDV不同地方分离株的VP1基因中与病毒致病型相关的一个片段(1 518bp~1 997bp,共480bp)进行扩增,并对所获得的VP1 480bp片段进行核苷酸的序列测定,与IBDV参考株和常用疫苗株的相应序列进行比较分析和绘制遗传进化树。结果表明,6个分离株与参考株在VP1RNA聚合酶基序Ⅵ和基序Ⅶ上均保守,在特征性氨基酸位点上,3个广西分离株QX0604、WZ0704和NN0603与参考的vvIBDV相同,而分离株BH111(广西)、JS17(江苏)和HUN0804(湖南)则既具有vvIBDV的位点特征,又具有经典毒株特征,但不同毒株在不同位点上表现不同;在同源性分析上,JS17、BH111、QX0604、WZ0704和NN0603等5个毒株与参考用vvIBDV毒株的同源性较高,在核苷酸和氨基酸水平上分别为92.5%~100.0%和97.5%~100.0%,但与2个常用疫苗株和经典毒株的同源性仅分别为87.9%~90.0%和96.2%~96.9%,分离株HUN0804则与经典毒株和2个疫苗株更接近;在遗传进化树上,JS17和BH111等5个分离株与vvIBDV在一个分支上,亲缘关系更近,而HUN0804则与经典毒株和2个疫苗株在另一个大分支。表明不同分离株在VP1的功能基序上保持保守,但分离株在特征性氨基酸位点上则发生了变化,大多数分离株与常用疫苗株之间的同源性较低,亲缘关系较远。

关 键 词:传染性法氏囊病病毒  VP1基因  反转录PCR  分子特征

Amplification and Sequence Analysis of VP1 Gene Fragment of Local Epidemic IBDV Isolates
HE Xiu-miao , CHEN Jia , KANG Si-na , CHEN Sheng-feng , WEI Mei-ping , WEI Ping. Amplification and Sequence Analysis of VP1 Gene Fragment of Local Epidemic IBDV Isolates[J]. Progress In Veterinary Medicine, 2015, 0(4): 19-23
Authors:HE Xiu-miao    CHEN Jia    KANG Si-na    CHEN Sheng-feng    WEI Mei-ping    WEI Ping
Affiliation:HE Xiu-miao;CHEN Jia;KANG Si-na;CHEN Sheng-feng;WEI Mei-ping;WEI Ping;School of Marine Sciences and Biotechnology,Guangxi University for Nationalities;Guangxi Key Laboratory of Chemistry and Engineering of Forest Products;Nanning Animal Health Supervision Institute;Guangxi University;
Abstract:
Keywords:Infectious bursal disease virus  VP1 gene  RT-PCR  molecular characteristic
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号